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公开(公告)号:CN114141308A
公开(公告)日:2022-03-04
申请号:CN202111405165.3
申请日:2021-11-24
Applicant: 东南大学 , 中移(成都)信息通信科技有限公司
Abstract: 本发明属于基因组数据分析领域,公开了一种基因组结构变异分布检测方法及装置,检测方法包括如下步骤:基因组测序数据的获取及过滤,计算相邻变异间的距离,利用分段常数拟合(Piecewise Constant Fitting,PCF)算法对基因组进行分割,可视化变异沿基因组的分布;检测装置包括输入模块、计算模块、基因组分割模块、可视化模块。本发明基于高通量测序数据,适用于任何基因组的VCF或MAF文件,利用PCF算法实现对基因组结构变异沿染色体分布的检测,有助于寻找基因组的突变热点区。
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公开(公告)号:CN114064280A
公开(公告)日:2022-02-18
申请号:CN202111381192.1
申请日:2021-11-20
Applicant: 东南大学 , 中移(成都)信息通信科技有限公司
Abstract: 本发明提出了一种多约束下的端边协同推断方法,该方法包括两个阶段,分别为端边协同推断模型分割阶段和在线动态调整阶段。其中,端边协同推断模型分割阶段能够在端边协同推断环境中,在智能终端设备能耗、内存大小等约束下,综合考虑智能终端设备和边缘设备的计算能力,对深度神经网络进行模型分割;在线动态调整阶段能够自适应调整模型分割位置,以适应端边协同推断环境中的动态变化。并针对多约束下的端边协同推断机制中的两个阶段,建立了端边协同推断数学模型,并提出了相应的求解算法。
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公开(公告)号:CN118866076A
公开(公告)日:2024-10-29
申请号:CN202311620816.X
申请日:2023-11-30
Applicant: 东南大学 , 中移(成都)信息通信科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种融合多组学数据筛选个性化肿瘤抗原的方法及其应用,本发明的预测方法高效准确,而且能够多维评估候选抗原肽,降低预测假阳性率,进而应用于临床病人新生抗原的预测及基于新抗原免疫疗法的研发,实现患者的靶向精准治疗,提高患者预后和生存质量。利用该方法针对肝细胞癌患者的体细胞突变位点得到的表位肽可以被患者的HLA‑A*02:01所递呈,可应用于肿瘤新抗原识别、肿瘤疫苗、双特异性抗体研发和过继性细胞疗法中,对于推动肿瘤免疫治疗领域发展具有重要价值。
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公开(公告)号:CN114064280B
公开(公告)日:2024-08-02
申请号:CN202111381192.1
申请日:2021-11-20
Applicant: 东南大学 , 中移(成都)信息通信科技有限公司
Abstract: 本发明提出了一种多约束下的端边协同推断方法,该方法包括两个阶段,分别为端边协同推断模型分割阶段和在线动态调整阶段。其中,端边协同推断模型分割阶段能够在端边协同推断环境中,在智能终端设备能耗、内存大小等约束下,综合考虑智能终端设备和边缘设备的计算能力,对深度神经网络进行模型分割;在线动态调整阶段能够自适应调整模型分割位置,以适应端边协同推断环境中的动态变化。并针对多约束下的端边协同推断机制中的两个阶段,建立了端边协同推断数学模型,并提出了相应的求解算法。
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公开(公告)号:CN114141308B
公开(公告)日:2024-11-05
申请号:CN202111405165.3
申请日:2021-11-24
Applicant: 东南大学 , 中移(成都)信息通信科技有限公司
Abstract: 本发明属于基因组数据分析领域,公开了一种基因组结构变异分布检测方法及装置,检测方法包括如下步骤:基因组测序数据的获取及过滤,计算相邻变异间的距离,利用分段常数拟合(Piecewise Constant Fitting,PCF)算法对基因组进行分割,可视化变异沿基因组的分布;检测装置包括输入模块、计算模块、基因组分割模块、可视化模块。本发明基于高通量测序数据,适用于任何基因组的VCF或MAF文件,利用PCF算法实现对基因组结构变异沿染色体分布的检测,有助于寻找基因组的突变热点区。
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