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公开(公告)号:CN114694754A
公开(公告)日:2022-07-01
申请号:CN202210411315.X
申请日:2022-04-19
Applicant: 中国医学科学院医学实验动物研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于图的多序列比对方法、系统、设备和计算机可读存储介质,方法其包括:获取一组泛基因组序列数据,对所述泛基因组序列数据进行构图,得到泛基因组的着色图;标记并获取所述着色图单个结点的访问状态的特征,遍历所述着色图得到将所述着色图分解后的cSupB数据模型;获取着色图分解后的cSupB数据模型,提取所述cSupB数据模型中结点的偏移值数据特征;基于所述偏移值数据特征对所述cSupB数据模型进行第一次预处理,得到所述cSupB数据模型的初始比对结果。本发明克服了目前在面对大量测序样本基因组时,传统的多序列比对方式无法满足现状的问题。
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公开(公告)号:CN102670636A
公开(公告)日:2012-09-19
申请号:CN201210086721.X
申请日:2012-03-28
Applicant: 中国医学科学院医学实验动物研究所
IPC: A61K31/7048 , A61P31/12
Abstract: 本发明涉及医药领域,特别涉及老鹳草素在制备治疗人肠道病毒71型感染引发疾病药物中的应用。本发明利用实验室所建立的EV71感染人横纹肌瘤细胞(RD)模型和小鼠模型,对老鹳草素抑制人肠道病毒71型复制和治疗人肠道病毒71型感染引发疾病的效果进行了研究,证实老鹳草素具有较好的治疗效果,具有发展成为临床治疗药物的潜力。
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公开(公告)号:CN114694754B
公开(公告)日:2025-02-11
申请号:CN202210411315.X
申请日:2022-04-19
Applicant: 中国医学科学院医学实验动物研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于图的多序列比对方法、系统、设备和计算机可读存储介质,方法其包括:获取一组泛基因组序列数据,对所述泛基因组序列数据进行构图,得到泛基因组的着色图;标记并获取所述着色图单个结点的访问状态的特征,遍历所述着色图得到将所述着色图分解后的cSupB数据模型;获取着色图分解后的cSupB数据模型,提取所述cSupB数据模型中结点的偏移值数据特征;基于所述偏移值数据特征对所述cSupB数据模型进行第一次预处理,得到所述cSupB数据模型的初始比对结果。本发明克服了目前在面对大量测序样本基因组时,传统的多序列比对方式无法满足现状的问题。
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公开(公告)号:CN114882956A
公开(公告)日:2022-08-09
申请号:CN202210412619.8
申请日:2022-04-19
Applicant: 中国医学科学院医学实验动物研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于图的泛基因组数据组织方法、系统、设备和计算机可读存储介质,方法其包括:获取一组泛基因组序列数据;对所述泛基因组序列数据进行构图,得到泛基因组的着色图;标记并获取所述着色图单个结点的访问状态的特征,遍历所述着色图得到将所述着色图分解后的cSupB数据模型、以及cSupB数据模型的数据信息;基于所述cSupB数据模型的数据信息确定所述cSupB数据模型之间的包含关系,根据所述包含关系构建cSupB结构树模型。本发明克服了目前在针对大量基因组数据时,数据组织方式混乱,对序列的可读性、有效性和完整性都较差的问题。
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公开(公告)号:CN114300039A
公开(公告)日:2022-04-08
申请号:CN202111673022.0
申请日:2021-12-31
Applicant: 中国医学科学院医学实验动物研究所
Abstract: 本发明涉及一种基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选系统。为了缩短了抗病毒新药研发周期、降低了研发成本、提高了研发的成功率,本发明提供了一种新的基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选系统,包括:用于获取待筛选的生物活性成分的结构文件及信息的第一获取单元,用于根据所述信息将待筛选的生物活性成分的结构文件输入相应的分子对接模块的选择单元,用于获取病毒结构蛋白的结构文件的第二获取单元,用于将所述病毒结构蛋白的结构文件与待筛选的生物活性成分的结构文件匹配到同一分子对接模块的匹配单元,分子对接单元和可视化单元。本发明简化了病毒结构蛋白生物活性成分筛选步骤,提高了筛选的速度和效率,具有非常好的实际应用价值。
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公开(公告)号:CN111154923A
公开(公告)日:2020-05-15
申请号:CN202010263752.2
申请日:2020-04-07
Applicant: 中国医学科学院医学实验动物研究所
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明涉及生物技术领域,公开了一种扩增新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因核苷酸片段的引物及其应用。本发明所述引物如SEQ ID NO:1所示和SEQ ID NO:2所示。本发明提供了一组用以扩增新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因核酸片段的上、下游引物,其以病毒cDNA为模板进行扩增能够排除背景基因组的非特异性干扰,特异性扩增新型冠状病毒的核苷酸片段。
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公开(公告)号:CN102178678A
公开(公告)日:2011-09-14
申请号:CN201110066315.2
申请日:2011-03-18
Applicant: 中国医学科学院医学实验动物研究所
Abstract: 本发明属于医药领域,公开了石蒜碱、石蒜碱盐、石蒜碱水合物、石蒜碱光学异构体或石蒜碱前药在治疗人肠道病毒71型感染引发疾病的药物的应用,作为优选,所述人肠道病毒71型感染引发的疾病为手足口病、疱疹性咽峡炎、病毒性脑膜炎、病毒性脑炎、迟缓性麻痹、肺水肿和病毒性心肌炎。体外及体内试验表明石蒜碱可以抑制EV71在细胞中的复制和病变,具有良好的抑制EV71病毒作用,具有临床应用前景。
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