一种基于图的多序列比对方法及其系统

    公开(公告)号:CN114694754A

    公开(公告)日:2022-07-01

    申请号:CN202210411315.X

    申请日:2022-04-19

    Abstract: 本发明公开了一种基于图的多序列比对方法、系统、设备和计算机可读存储介质,方法其包括:获取一组泛基因组序列数据,对所述泛基因组序列数据进行构图,得到泛基因组的着色图;标记并获取所述着色图单个结点的访问状态的特征,遍历所述着色图得到将所述着色图分解后的cSupB数据模型;获取着色图分解后的cSupB数据模型,提取所述cSupB数据模型中结点的偏移值数据特征;基于所述偏移值数据特征对所述cSupB数据模型进行第一次预处理,得到所述cSupB数据模型的初始比对结果。本发明克服了目前在面对大量测序样本基因组时,传统的多序列比对方式无法满足现状的问题。

    一种基于图的多序列比对方法及其系统

    公开(公告)号:CN114694754B

    公开(公告)日:2025-02-11

    申请号:CN202210411315.X

    申请日:2022-04-19

    Abstract: 本发明公开了一种基于图的多序列比对方法、系统、设备和计算机可读存储介质,方法其包括:获取一组泛基因组序列数据,对所述泛基因组序列数据进行构图,得到泛基因组的着色图;标记并获取所述着色图单个结点的访问状态的特征,遍历所述着色图得到将所述着色图分解后的cSupB数据模型;获取着色图分解后的cSupB数据模型,提取所述cSupB数据模型中结点的偏移值数据特征;基于所述偏移值数据特征对所述cSupB数据模型进行第一次预处理,得到所述cSupB数据模型的初始比对结果。本发明克服了目前在面对大量测序样本基因组时,传统的多序列比对方式无法满足现状的问题。

    一种基于图的泛基因组数据组织方法及其系统

    公开(公告)号:CN114882956A

    公开(公告)日:2022-08-09

    申请号:CN202210412619.8

    申请日:2022-04-19

    Abstract: 本发明公开了一种基于图的泛基因组数据组织方法、系统、设备和计算机可读存储介质,方法其包括:获取一组泛基因组序列数据;对所述泛基因组序列数据进行构图,得到泛基因组的着色图;标记并获取所述着色图单个结点的访问状态的特征,遍历所述着色图得到将所述着色图分解后的cSupB数据模型、以及cSupB数据模型的数据信息;基于所述cSupB数据模型的数据信息确定所述cSupB数据模型之间的包含关系,根据所述包含关系构建cSupB结构树模型。本发明克服了目前在针对大量基因组数据时,数据组织方式混乱,对序列的可读性、有效性和完整性都较差的问题。

    一种基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选系统

    公开(公告)号:CN114300039A

    公开(公告)日:2022-04-08

    申请号:CN202111673022.0

    申请日:2021-12-31

    Abstract: 本发明涉及一种基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选系统。为了缩短了抗病毒新药研发周期、降低了研发成本、提高了研发的成功率,本发明提供了一种新的基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选系统,包括:用于获取待筛选的生物活性成分的结构文件及信息的第一获取单元,用于根据所述信息将待筛选的生物活性成分的结构文件输入相应的分子对接模块的选择单元,用于获取病毒结构蛋白的结构文件的第二获取单元,用于将所述病毒结构蛋白的结构文件与待筛选的生物活性成分的结构文件匹配到同一分子对接模块的匹配单元,分子对接单元和可视化单元。本发明简化了病毒结构蛋白生物活性成分筛选步骤,提高了筛选的速度和效率,具有非常好的实际应用价值。

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