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公开(公告)号：CN115798575A
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202310065212.7
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对头孢他啶敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括：计算单元；计算单元包括：计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为KPC‑1、sul1、CTX‑M‑55、CTX‑M‑15、TEM‑1基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对头孢他啶敏感性的预测的准确率约90.6%。
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公开(公告)号：CN114898808B
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210823538.7
申请日：2022-07-14
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明“一种预测肺炎克雷伯菌对头孢吡肟敏感性的方法及系统”属于分子生物技术领域。所述方法的特征是：按下述公式I计算h(x)值：公式I：；其中，C1‑C5分别为TEM‑1基因、KPC‑1基因、CTX‑M‑65、rmtB基因、AAC(6’)‑Ib‑cr6基因分别在待预测的肺炎克雷伯菌菌株中的拷贝数。采用本发明的方法和系统进行肺炎克雷伯菌对头孢吡肟敏感性的预测的准确率约93%。
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公开(公告)号：CN113151598A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110423087.3
申请日：2021-04-20
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种呼吸道RNA病原体(甲流、乙流、合胞病毒、新冠)NGS引物组及试剂盒，所述引物组由594条引物序列组成。本发明针对甲流、乙流、合胞病毒和新型冠状病毒基因组特定设计了594个引物，覆盖整个病毒基因组，提高了病毒的检测并大大提高了病毒基因组序列全长检测的可能，无需PCR扩增即可快速实现病毒基因组全覆盖。
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公开(公告)号：CN115798574A
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202310065167.5
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对美罗培南敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括：计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中C1‑C5分别为mphA、marA、Klebsiella pneumoniae KpnE、KPC‑1、floR基因在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对美罗培南敏感性的预测的准确率约99.4%。
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公开(公告)号：CN113151598B
公开(公告)日：2022-05-03
申请号：CN202110423087.3
申请日：2021-04-20
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种呼吸道RNA病原体(甲流、乙流、合胞病毒、新冠)NGS引物组及试剂盒，所述引物组由594条引物序列组成。本发明针对甲流、乙流、合胞病毒和新型冠状病毒基因组特定设计了594个引物，覆盖整个病毒基因组，提高了病毒的检测并大大提高了病毒基因组序列全长检测的可能，无需PCR扩增即可快速实现病毒基因组全覆盖。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN115798576B
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310065262.5
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对亚胺培南敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为bleomycin resistance determinant、ramA、mphA、KPC‑1、catI基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对亚胺培南敏感性的预测的准确率约99.4%。
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公开(公告)号：CN115798577B
公开(公告)日：2023-04-21
申请号：CN202310065354.3
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对左氧氟沙星敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为TEM‑1、OmpA、AAC(6')‑Ib‑cr6、KPC‑1、QnrS1基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对左氧氟沙星敏感性的预测的准确率约89.5%。
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公开(公告)号：CN115881213A
公开(公告)日：2023-03-31
申请号：CN202310065171.1
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对哌拉西林‑他唑巴坦敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；其被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；按下述计算步骤计算：S1：按公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为dfrA12、KPC‑1、determinant of bleomycin resistance、mphA、sul2基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对哌拉西林‑他唑巴坦敏感性的预测的准确率约98.3%。
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公开(公告)号：CN115862730B
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310065401.4
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对头孢西丁敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为ramA、sul1、KPC‑1、DHA‑1、bleomycin resistance determinant基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对头孢西丁敏感性的预测的准确率约94.7%。
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公开(公告)号：CN115798574B
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310065167.5
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对美罗培南敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括：计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中C1‑C5分别为mphA、marA、Klebsiella pneumoniae KpnE、KPC‑1、floR基因在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对美罗培南敏感性的预测的准确率约99.4%。
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