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公开(公告)号：CN113930847A
公开(公告)日：2022-01-14
申请号：CN202111132170.1
申请日：2021-09-26
Applicant: 东南大学
IPC: C40B40/06 , C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种空间转录组位置信息编码芯片及其制备方法和应用，所述空间转录组位置信息编码芯片包括化学基团修饰的基片以及与化学基团相连接的至少两轮编码引物形成的引物阵列芯片。本发明的空间转录组位置信息编码芯片能够实现组织切片的全覆盖位置标记、提高空间分辨率以及降低科研成本。
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公开(公告)号：CN113270142A
公开(公告)日：2021-08-17
申请号：CN202110549592.2
申请日：2021-05-19
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于瞬态编码的空间转录组测序解码方法，包括如下步骤：基于寡核苷酸链编码的空间信息编码微球的设计；瞬态编码引物的设计与使用；组织切片处理及信使RNA的捕获；建库测序及分析定位。本方法可以获得高分辨的空间转录组测序，极限情况下可以达到亚细胞分辨率(5μm)，从而可以准确获取组织切片中特定位点上的基因表达情况；本方法成本低廉，规避了成本高昂的光学空间位置信息解码，使得本方法可以以近乎单细胞转录组测序的成本进行空间转录组测序。
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公开(公告)号：CN110106230A
公开(公告)日：2019-08-09
申请号：CN201910370618.X
申请日：2019-05-05
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明提供了一种孕妇外周血胎儿DNA的富集方法，本发明主要通过固定特异性抗体的磁性微球与孕妇血浆内的外泌体结合，捕获胎儿外泌体，从而从胎儿外泌体中提取DNA。本发明方法能从孕妇血浆/血清中分离胎儿外泌体，并且从中提取胎儿DNA，非常高效的获得极其微量的胎儿DNA，方法简单、实用、高效，也适用于多个样本的同时处理。
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公开(公告)号：CN102559864B
公开(公告)日：2014-04-16
申请号：CN201110291304.4
申请日：2011-09-29
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及可进行单分子核酸扩增的颗粒、其制备方法及应用。所述可进行单分子核酸扩增的颗粒，表面结合有多条单链核酸和一条双链核酸，所述双链核酸通过其中一条序列的一端与颗粒表面连接，并可作为双链接头与待测序核酸、以及末端双链接头顺序连接，然后变性形成一条单链核酸分子模板，所述单链核酸分子模板可以以颗粒表面的单链核酸作为引物进行有效PCR扩增，在颗粒表面形成多条双链测序模板，再将所述多条双链测序模板转化为多条单链测序模板后用于检测待测序核酸的信息。所述可进行单分子核酸扩增的颗粒的制备方法为：(1)使单链核酸连接到所述颗粒表面；(2)使所述每颗颗粒表面至多连接一条双链核酸。
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公开(公告)号：CN102140523B
公开(公告)日：2013-08-07
申请号：CN201110030788.7
申请日：2011-01-28
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 高通量测序模板的原位复制及其增加阅读长度的测序方法，已经制备好的DNA测序模板，在测序得到一段序列片段后，将其变性为DNA单链－旧模板，再通过活化先前引入的延伸引物将其复制，并将旧模板全部切除后，得到与原来DNA测序模板完全互补的DNA单链－新模板，将这些DNA单链作为DNA测序模板进行序列测定，便得到与旧模板另一端、且互补的新测定序列，将新、旧模板测定的序列片段拼接，增加了测序模板的阅读长度，降低了短片段序列拼接的困难，提高序列的准确性。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101570784A
公开(公告)日：2009-11-04
申请号：CN200910026892.1
申请日：2009-06-03
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明基于信号组合编码的DNA连接测序方法涉及一种采用信号组合编码的DNA连接测序方法，属于生物技术领域。本发明的特征在于连接测序反应中的信号编码，实现了利用相同数量标记物，在一次连接反应中同时检测标记物的指数量的碱基类型的测序过程，成倍缩短测序时间，大幅提高测序通量，降低测序成本。本发明利用现有多个标记物在被检测时信号状态的组合进行编码，并与所测碱基的种类一一对应，由于多个标记物信号状态组合数量随着标记物种类的数量的增加而呈现指数增长，提高了相同数量标记物的分辨力，从而达到在一次测序反应中检测标记物的指数量碱基类型的目的。
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公开(公告)号：CN101059518A
公开(公告)日：2007-10-24
申请号：CN200710022371.X
申请日：2007-05-15
Applicant: 东南大学
Abstract: 一种基于移动切割内切酶的DNA结合蛋白检测方法针对被测的DNA结合蛋白的识别序列设计一段双链核酸探针，其中一条单链5’端标记一个连接基团1并固定到固相载体表面2，另一条单链5’端标记一个信号分子6；在含有待测蛋白的识别位点3的3’端设计一个IIS型内切酶识别位点5，调节两识别位点的间距，使酶切位点4位于待测蛋白结合位点3之中。操作过程为：I.将可能含有待测DNA结合蛋白的溶液与固定化的双链探针一起孵育，然后在内切酶体系中进行酶切反应；II.当待测蛋白存在时，信号分子保留在载体表面，而无待测蛋白时，探针便被内切酶在空闲的蛋白结合位点中切断；III.根据信号强度实现对待测蛋白的非标记检测。
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公开(公告)号：CN1605861A
公开(公告)日：2005-04-13
申请号：CN200410065713.2
申请日：2004-11-15
Applicant: 东南大学
IPC: G01N27/417 , G01N27/26
Abstract: 电化学定量聚合酶链式反应检测芯片的制备方法涉及一种核酸定量聚合酶链式反应芯片的电化学检测技术，其制备的方法为：在固体载体的表面上制备一组电极微阵列；在电极微阵列的电极上固定核酸捕获的分子探针；在固定有核酸捕获的分子探针的电极区域制备一个能够装载液体的全封闭的微小腔体；在固体载体的电极上接有连接电线，检测方法为；把核酸、酶、脱氧核糖核苷酸、电化学活性物质等反应组分加入微小腔体中；将芯片置于一个可以进行温度控制的大腔体中；通过恒电位仪来检测电极表面的捕获DNA探针分子上因为发生反应而产生的电流电压的变化；通过检测不同电极上PGR循环过程中的电流电压的变化规律对多个基因进行PCR定量检测。
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公开(公告)号：CN1597986A
公开(公告)日：2005-03-23
申请号：CN200410041452.0
申请日：2004-07-22
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 一种发卡结构探针的DNA芯片及其应用方法是一种用于所有提取的DNA、RNA或它们的核酸序列扩增产物检测的芯片及其应用方法，芯片由固定基质和探针所组成，该探针近5’端和近3’端之间有3～20个碱基互补而形成一个发卡结构，该探针无需任何荧光标记物，其5’端固定在固体基质表面，3’端至中间的环状序列与被检测的靶标核酸完全或部分互补。该芯片与标记的或非标记的靶标核酸杂交，与非标记的靶标核酸杂交后在片延伸反应，在反应过程中引入标记分子，与标记的核酸杂交后便可之间进行信号检测。该芯片探针的杂交区域的中间碱基上引入一个突变位点，可用于SNP、点突变的高通量检测。
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公开(公告)号：CN118010459A
公开(公告)日：2024-05-10
申请号：CN202410100012.5
申请日：2024-01-24
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明公开了一种脑组织切片的染色试剂及其应用。所述染色试剂包括无水乙醇和人工脑脊液组成的缓冲液，以及溶解于缓冲液中的甲酚紫。本发明首次发现在含有甲酚紫的染色试剂中加入人工脑脊液不仅能够对中枢神经系统起到物理性支持和保护作用，而且可以为脑组织冷冻切片提供相对稳定的内环境，使样本RNA的降解更低，能够有效保护脑组织切片中的RNA的完整性。且该方法总体用时短、操作简单、染色成本低，染色试剂可长期保存，能够广泛地应用于脑科学研究之中。
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