公开(公告)号：CN116453597A

公开(公告)日：2023-07-18

申请号：CN202310369928.6

申请日：2023-04-07

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 俞章盛 ,  袁欣 ,  马嫣然

IPC: G16B30/00 ,  G16B20/00 ,  G16B40/20

Abstract: 本发明涉及一种用于空间转录组学数据的空间可变基因识别方法，该方法包括：通过半池化方法对原始数据进行数据转换和特征提取；对半池化处理得到的输出数据进行稳定性检验；对稳定性检验结果进行组合测试，从而识别空间可变基因。与现有技术相比，本发明具有识别准确度高，计算速度快等优点。

公开(公告)号：CN116313146A

公开(公告)日：2023-06-23

申请号：CN202211091612.7

申请日：2022-09-07

Applicant: 上海交通大学医学院

Inventor： 俞章盛 ,  冯铁男 ,  孔伟民 ,  吕文文

IPC: G16H70/20 ,  G06F16/245 ,  G06F16/26 ,  G06F16/248 ,  G06F16/23 ,  G06F16/21

Abstract: 本申请实施例公开了一种临床研究管理方法、系统及存储介质，所述临床研究管理方法应用于临床研究平台，所述临床研究平台包括：人工智能算法管理模块、临床数据管理模块和临床研究管理模块，所述临床研究管理方法包括以下步骤：通过所述人工智能算法管理模块，定义不同算法的数据调用自定义功能，获取所需数据，基于对应的标准化输入数据的算法，输出模型；通过所述临床数据管理模块，对所述数据进行查询、导出和/或展示操作；通过所述临床研究管理模块，自我迭代更新临床研究规范，使所述数据和所述算法符合临床研究规范，基于所述数据和算法开展符合所述临床研究规范的临床研究。

公开(公告)号：CN114742758A

公开(公告)日：2022-07-12

申请号：CN202210224218.X

申请日：2022-03-09

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 俞章盛 ,  鹿可·约翰斯通

IPC: G06T7/00 ,  G06T7/11 ,  G06T5/00 ,  G06K9/62 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08 ,  G06V10/764 ,  G06V10/82

Abstract: 本发明涉及一种全视野数字切片组织病理图片中的细胞核分类方法，包括：对患者的组织病理学WSI进行预处理，并根据处理后的WSI中细胞核的核质心到像素的经验密度对虚拟类别进行分层，并获取训练集和验证集；以空间区域为目标，对类不平衡的影像提升分类F1水平，并提取核特征；核特征提取后，采用Hovernet中的三个独立的密集连接解码器分别执行核检测、像素到核质心的水平和垂直距离估计以及对核预测进行分类；采用拥有多个目标函数组合的成本函数最小化目标函数，获取最终细胞核分类结果。与现有技术相比，本发明具有显著提高MSE，有助于模型对类进行更好地学习，以及提升分类结果准确度等优点。