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公开(公告)号:CN119799953A
公开(公告)日:2025-04-11
申请号:CN202510073387.1
申请日:2025-01-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种基于全基因组序列的小麦条锈菌SNP纯合位点的分子标记及其应用。该发明通过对全球28株小麦条锈菌基因组序列进行分析,与参考基因组进行比对,挖掘出了超过百万个SNP位点。经过测序深度筛选、连锁不平衡分析和杂合度检测,鉴定出1076个SNP纯合位点。进一步基于次等位基因频率、缺失率和相邻简单重复序列的筛选,最终确定了37个核心SNP标记。通过对这些SNP位点进行引物设计,并添加荧光接头,开发出KASP‑SNP分子标记,可用于对小麦条锈菌群体进行精准的基因型分型鉴定。本发明基于全球小麦条锈菌全基因组开发的分子标记,适用于全球各地区的小麦条锈菌群体研究。基于纯合位点的分子标记开发,能够有效排除因杂合位点造成的多态性差异,确保检测位点的准确性。该套KASP‑SNP分子标记具有高多态性、良好重复性和高检测效率,可广泛应用于小麦条锈菌群体的遗传学研究。
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