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公开(公告)号:CN119470916A
公开(公告)日:2025-02-18
申请号:CN202411626144.8
申请日:2024-11-14
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 复旦大学
IPC: G01N33/68 , G01N33/574
Abstract: 本发明公开一种用于结直肠癌诊断的细胞外囊泡蛋白质标志物组合及其应用,属于医学分子诊断技术领域。所述的用于结直肠癌诊断的标志物为CTTN、HNRNPK和PSMC6蛋白的组合,来源于组织细胞外囊泡或血浆细胞外囊泡,与结直肠癌诊断有较高相关性。本发明提供的生物标志物可辅助现有的结直肠癌诊断手段,能够精准鉴别CEA、CA19‑9水平正常的结直肠癌患者,以提高结直肠癌患者的检出率。
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公开(公告)号:CN112067684A
公开(公告)日:2020-12-11
申请号:CN201910503816.9
申请日:2019-06-11
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质分析领域,涉及一种基于噻唑烷化学固相富集糖肽并质谱分析的方法,包括:利用高碘酸纳将糖肽糖链部分的羟基氧化为醛基,将半胱氨酸修饰的磁性纳米材料置于氧化后的糖肽溶液中,通过磁性纳米材料表面的β‑氨基硫醇基团与氧化后糖肽的醛基之间形成噻唑烷衍生物,将糖肽固定在磁性纳米材料上,清洗除去未共价结合的非糖肽,最后利用去糖链酶将捕获的糖肽从磁性纳米材料上释放下来,并送入质谱分析。本发明方法步骤简单、操作方便,可实现糖肽的超快速、高特异、高灵敏质谱分析。
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公开(公告)号:CN108226317B
公开(公告)日:2020-10-20
申请号:CN201611190958.7
申请日:2016-12-21
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属蛋白质分析领域,涉及基于细胞层面的全蛋白质组学分析的方法,本发明中,收集的细胞直接通过吸胀的方式进入真空干燥后的聚丙烯酰胺凝胶粒中,然后直接进行胶内酶解获得质谱分析所需的肽段;本方法中不需要单独的细胞裂解和蛋白提取步骤,使四个基本步骤减少为两步,在不提高酶量的情况下,实验耗时明显缩短;本方法与传统方法比较,在细胞蛋白质组鉴定,尤其是高分子量蛋白的鉴定上存在明显优势;本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现同时进行细胞裂解和蛋白酶解,为高灵敏质谱分析提供样品保证;由于摆脱了对去垢剂的依赖,适用于后续诸多翻译后修饰的研究。
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公开(公告)号:CN111089969A
公开(公告)日:2020-05-01
申请号:CN201811243022.5
申请日:2018-10-24
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N33/68
Abstract: 本发明属糖蛋白质组学和糖组学分析领域,涉及一种N-糖链快速酶解释放和固相富集并质谱分析的方法,其包括:使用脱脂棉材料吸取含糖蛋白样品的溶液,并在棉上进行高温快速PNGase F酶解释放N-糖链;在酶解结束后调节溶液环境,利用脱脂棉材料表面高密度的羟基与糖链的氢键等作用,将游离糖链吸附在脱脂棉材料上,随后将未和脱脂棉材料结合的非糖链分子,如蛋白质、多肽等清洗除去,最后使用水溶液将吸附的糖链洗脱,送入质谱分析。本发明方法使用材料廉价易得,易于制备,操作简便,可以实现N-糖蛋白的高速酶解及N-糖链的高选择性富集、高灵敏度质谱分析。
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公开(公告)号:CN109142506A
公开(公告)日:2019-01-04
申请号:CN201710460611.8
申请日:2017-06-18
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属生化分析技术领域,涉及一种基于质谱的N‑糖链相对定量的方法,本方法利用苯胺功能化的大环化合物标记N‑糖链再螯合稀土金属离子相对定量,其中采用苯胺功能化的DOTA对N‑糖链衍生,在螯合稀土金属离子Ho3+/Lu3+,两步反应均具有较高的衍生效率;测试结果显示,通过衍生上螯合了稀土金属离子的DOTA后,能提高糖链在MALDI‑MS负离子反射模式下的离子化效率,并改善糖链在质谱中的碎裂,有助于糖链结构解析。本发明用于大肠癌病人与正常人血清中N‑糖链表达水平的差异分析结果显示,本方法通过螯合不同的稀土金属离子,能实现多标标记定量,并具有很好的定量准确性及重复性。
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公开(公告)号:CN103364494B
公开(公告)日:2015-04-22
申请号:CN201210096008.3
申请日:2012-03-31
Applicant: 复旦大学
IPC: C07K1/00
Abstract: 本发明属生化分析领域,涉及一种血清糖肽组高选择性富集的新方法。尤其是利用功能化有序介孔纳米材料对血清糖肽组高选择性富集的方法。本发明选用具有合适孔径大小的功能化介孔纳米材料作为样品吸附剂,利用结合功能基团的糖肽捕获和介孔的尺寸排阻双重能力对血清中内源性糖基化多肽进行富集,PNGase F糖苷酶切除糖链后进行纳升级液相色谱串联质谱分析,数据库搜索鉴定氨基酸序列和相应的糖基化位点,成功实现了对血清糖肽组学的揭示。本发明提供了一种步骤简单、操作方便、快速高效,适应糖肽组学研究要求,高灵敏度检测和鉴定内源性糖基化多肽进而揭示血清糖肽组学的高选择性富集的新方法。
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公开(公告)号:CN105300783A
公开(公告)日:2016-02-03
申请号:CN201410331835.5
申请日:2014-07-13
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属蛋白质分析领域,涉及一种利用氨氧基修饰的磁性纳米材料富集糖基化肽的新方法,其包括:首先对糖肽上的羟基进行高碘酸纳NaIO4氧化使得羟基变为醛基,再将氨氧基修饰的磁性纳米材料Fe3O4@ONH2置于氧化后的糖肽溶液中,通过氨氧基基团和糖肽中糖链氧化后得到的醛基之间反应,将糖肽固定在磁性纳米材料上,随后将未和纳米材料反应的非糖肽清洗除去,最后再利用去糖链酶将捕获的糖肽从材料上解离下来,送入质谱分析糖基化肽。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现糖基化肽的高灵敏、高选择性质谱分析。
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公开(公告)号:CN103969321A
公开(公告)日:2014-08-06
申请号:CN201310031923.9
申请日:2013-01-24
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属生化分析领域,涉及一种固定化酶原位酶解组织切片实现蛋白鉴定并应用于质谱成像的新方法。本发明利用表面具有羟基羧基等亲水基团的氧化石墨烯固定胰蛋白酶,通过提高酶解效率,实现组织切片上蛋白质的原位高效酶解及鉴定,并将其应用于质谱成像技术,确定了切片中蛋白质的分布。本发明所选用的载体材料氧化石墨烯具有极强的吸附能力,可在短时间内吸附胰蛋白酶,利用限域效应极大提高了胰蛋白酶的酶解效率,有效促进了组织切片原位酶解及蛋白的鉴定。本发明具有步骤简单、操作方便、快速高效等特点,可广泛用于蛋白质组学相关领域。
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公开(公告)号:CN103940894A
公开(公告)日:2014-07-23
申请号:CN201310025887.5
申请日:2013-01-23
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属蛋白质分析领域,涉及富集磷酸化肽和糖基化肽的方法,具体涉及一种利用氨基修饰的磁性纳米材料同时选择性富集磷酸化肽和糖基化肽的新方法。本发明通过一锅法合成了氨基修饰的磁性纳米材料Fe3O4@NH2,利用磁性材料Fe3O4和磷酸化肽之间的螯合作用以及材料表面带正电的氨基和带负电的磷酸肽之间的静电作用,实现磷酸化肽段的选择性富集;利用磁性纳米材料表面氨基的亲水性实现糖肽的选择性富集;进一步实现磷酸化肽段和糖基化肽段的同时富集和质谱分析。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现磷酸化肽和糖基化肽的同时高灵敏质谱分析。
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公开(公告)号:CN103364494A
公开(公告)日:2013-10-23
申请号:CN201210096008.3
申请日:2012-03-31
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N30/02
Abstract: 本发明属生化分析领域,涉及一种血清糖肽组高选择性富集的新方法。尤其是利用功能化有序介孔纳米材料对血清糖肽组高选择性富集的方法。本发明选用具有合适孔径大小的功能化介孔纳米材料作为样品吸附剂,利用结合功能基团的糖肽捕获和介孔的尺寸排阻双重能力对血清中内源性糖基化多肽进行富集,PNGase F糖苷酶切除糖链后进行纳升级液相色谱串联质谱分析,数据库搜索鉴定氨基酸序列和相应的糖基化位点,成功实现了对血清糖肽组学的揭示。本发明提供了一种步骤简单、操作方便、快速高效,适应糖肽组学研究要求,高灵敏度检测和鉴定内源性糖基化多肽进而揭示血清糖肽组学的高选择性富集的新方法。
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