公开(公告)号：CN119339797A

公开(公告)日：2025-01-21

申请号：CN202411386711.7

申请日：2024-09-30

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 韦中 ,  王孝芳 ,  梁青青 ,  沈易 ,  江高飞 ,  杨欣润 ,  徐阳春 ,  沈其荣

IPC: G16B30/00 ,  G16B40/20 ,  G16B50/00 ,  G06N20/00

Abstract: 本发明公开了一种基于18S rRNA和ITS扩增子测序检测致病真菌复合污染的方法，包括：S1、构建非冗余致病真菌数据库；S2、对样品DNA的提取；S3、进行样品的18S rRNA或ITS基因测序，获得测序下机数据；S4、基于测序下机数据获取代表性序列；S5、将代表性序列与致病真菌数据库比对注释致病真菌，得到仅包含潜在致病真菌的ASV物种表，然后进行物种多样性和群落结构分析，预测复合污染风险指数。传统致真菌检测利用分离培养方法，耗时长、操作繁琐且灵敏度低，需要几周时间且很容易忽略一些微量的致病真菌。本发明无需分离培养，直接通过DNA测序和分析，可大幅度提升检测效率。