公开(公告)号：CN116469466B

公开(公告)日：2024-02-09

申请号：CN202310379493.3

申请日：2023-04-11

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 陈发棣 ,  苏江硕 ,  欧潇莉 ,  楼啦 ,  张飞 ,  陈素梅 ,  管志勇 ,  房伟民

IPC: G16B30/00 ,  C12Q1/6895 ,  G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G06F18/2135 ,  G06N5/01 ,  G06N20/10 ,  G06N7/01

Abstract: 涝性分子育种领域具有广阔的应用前景，同时本本发明公开了一种高效预测菊花耐涝性的 发明也可为菊花其他重要性状的分子育种提供方法及其应用。本发明通过全基因组关联分析鉴 依据。定菊花耐涝性显著相关的SNP位点，并在此基础上，比较了不同统计模型和不同密度SNP标记对全基因组预测效果的影响，建立了一种快速、高效、精准筛选优异耐涝菊花品种的方法，预测准确度可达0.949。基于本发明的方法预测出的体系在选育耐涝菊花品种时，不仅能够实现菊花耐涝性的早期选择，缩短育种周期，还有效克服了(56)对比文件Zhiwu Zhang等.Mixed linear modelapproach adapted for genome-wideassociation studies《.nature genetics》.2010,第1-9页.Jiangshuo Su等.Genome-wideassociation study identifies favorableSNP alleles and candidate genes forwaterlogging tolerance in chrysanthemums.《Horticulture Research》.2019,第6卷(第2019期),第1-13页.

公开(公告)号：CN116469466A

公开(公告)日：2023-07-21

申请号：CN202310379493.3

申请日：2023-04-11

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 陈发棣 ,  苏江硕 ,  欧潇莉 ,  楼啦 ,  张飞 ,  陈素梅 ,  管志勇 ,  房伟民

IPC: G16B30/00 ,  C12Q1/6895 ,  G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G06F18/2135 ,  G06N5/01 ,  G06N20/10 ,  G06N7/01

Abstract: 本发明公开了一种高效预测菊花耐涝性的方法及其应用。本发明通过全基因组关联分析鉴定菊花耐涝性显著相关的SNP位点，并在此基础上，比较了不同统计模型和不同密度SNP标记对全基因组预测效果的影响，建立了一种快速、高效、精准筛选优异耐涝菊花品种的方法，预测准确度可达0.949。基于本发明的方法预测出的体系在选育耐涝菊花品种时，不仅能够实现菊花耐涝性的早期选择，缩短育种周期，还有效克服了耐涝性田间鉴定工作量大、周期长、易受环境因素和人为主观因素的影响等技术难题，在菊花耐涝性分子育种领域具有广阔的应用前景，同时本发明也可为菊花其他重要性状的分子育种提供依据。