公开(公告)号：CN104593508A

公开(公告)日：2015-05-06

申请号：CN201510040811.9

申请日：2015-01-23

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 娄群峰 ,  张振涛 ,  张云霞 ,  李子昂 ,  陈劲枫

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11 ,  C12N15/10

Abstract: 本发明公开了黄瓜6号染色体探针制备的方法和应用。它是基于黄瓜基因组序列，通过RepeatMasker软件和黄瓜基因组数据库BLAST分析选取不含重复序列的DNA序列，利用Primer Premier 5.0软件进行引物设计。通过PCR扩增获得覆盖单染色体的PCR产物，将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳纯化，利用核酸浓度测量仪测定浓度后，将每对引物等量的产物进行混池，并用缺刻平移法标记探针，并利用荧光原位杂交技术杂交到染色体制片上，完成单染色体探针的制备和检测应用。通过应用此方法，可以快速获得黄瓜单染色体或者任何染色体区段的探针，可对单染色体或任何染色体的形态结构进行精确的分析研究。

公开(公告)号：CN104004849A

公开(公告)日：2014-08-27

申请号：CN201410257785.0

申请日：2014-06-09

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 娄群峰 ,  张云霞 ,  张振涛 ,  杨树琼 ,  王筠竹 ,  陈劲枫

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6841 ,  C12Q2543/10

Abstract: 本发明公开了利用黄瓜基因组原位杂交技术快速构建黄瓜中期染色体核型的方法，它是通过提取黄瓜基因组DNA，并将其标备探针。取黄瓜根尖进行酶解，火焰干燥法制片，获得分散度良好的中期染色体制片。将基因组DNA探针变性后杂交到变性的中期染色体制片上，利用高严谨度的杂交条件，使得染色体串联重复序列产生清晰可辨的荧光信号，从而构建黄瓜的中期染色体核型。本发明利用黄瓜基因组DNA作为探针，通过一次GISH快速构建黄瓜中期染色体核型，提高了试验效率。通过此方法，基于黄瓜基因组DNA探针在每条染色体上信号分布模式的不同，可快速构建出黄瓜中期染色体核型，为物种的核型分析研究提供了新的方法与参考。