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公开(公告)号：CN109554496A
公开(公告)日：2019-04-02
申请号：CN201811542646.7
申请日：2018-12-17
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明提供了一种检测胁迫处理前后植物中转座子活性变化的方法，属于遗传学技术领域，所述方法包括以下步骤：1)分别提取胁迫处理前与处里后样品的总RNA；2)利用所述总RNA分别构建胁迫处理前、后样品的cDNA文库；3)对所述cDNA文库进行测序；4)从测序原始数据中分别筛选siRNA，合并筛选到的siRNA从而获得总siRNA，对所述总siRNA进行cluster聚类；5)利用repeatmasker软件提取全基因组数据中的repeat，得出所述植物全基因组转座子位置信息；6)通过siRNA cluster表达量变化得到处理前后植株中转座子的活性变化。所述方法填补了植物转座子活性检测领域的技术空白。
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