一种用于基因相似性分析的加速装置、方法和计算机设备

    公开(公告)号:CN110990063A

    公开(公告)日:2020-04-10

    申请号:CN201911191604.8

    申请日:2019-11-28

    Abstract: 本发明实施例提供了一种用于基因相似性分析的加速装置、方法和计算机设备,该加速装置包括高速通信接口,用于与主机通信,接收主机分发的待加速处理的任务;序列缓存模块,用于缓存来自主机的一个或者多个任务,每个任务包含待进行基因相似性分析的多个基因序列数据;阵列处理机,其上设有用于处理任务的处理单元,处理单元中设有基于数据驱动的流式计算模式处理任务的完整流水线,流水线中配置有处理任务所需的多个定点计算部件;控制模块,其被配置为用于将序列缓存模块中的待处理的任务分配给处理单元;任务缓存模块,其上设置有任务缓存单元,用于缓存分配给处理单元的待处理任务。本发明能够提高基因相似性分析的效率,快速得到分析结果。

    一种用于基因相似性分析的加速装置、方法和计算机设备

    公开(公告)号:CN110990063B

    公开(公告)日:2021-11-23

    申请号:CN201911191604.8

    申请日:2019-11-28

    Abstract: 本发明实施例提供了一种用于基因相似性分析的加速装置、方法和计算机设备,该加速装置包括高速通信接口,用于与主机通信,接收主机分发的待加速处理的任务;序列缓存模块,用于缓存来自主机的一个或者多个任务,每个任务包含待进行基因相似性分析的多个基因序列数据;阵列处理机,其上设有用于处理任务的处理单元,处理单元中设有基于数据驱动的流式计算模式处理任务的完整流水线,流水线中配置有处理任务所需的多个定点计算部件;控制模块,其被配置为用于将序列缓存模块中的待处理的任务分配给处理单元;任务缓存模块,其上设置有任务缓存单元,用于缓存分配给处理单元的待处理任务。本发明能够提高基因相似性分析的效率,快速得到分析结果。

    一种光神经元结构和包含该结构的神经网络处理系统

    公开(公告)号:CN109376855B

    公开(公告)日:2021-04-06

    申请号:CN201811532813.X

    申请日:2018-12-14

    Abstract: 本发明提供一种光神经元结构和包含该结构的神经网络处理系统。该神经元结构包括突触输入调制模块、突触权值调制模块、光线聚合模块和光强度探测模块,其中,突触输入调制模块用于接收光信号并在与输入神经元关联的电信号的控制下执行光路调制;突触权值调制模块用于在与权值关联的电信号控制下执行对所述承载输入神经元的光信号进行调制;光线聚合模块用于对多个突触权值调制模块的输出光信号进行聚合;光强度探测模块用于将来自于光线聚合模块的输出光信号转换为电信号并执行激活操作。本发明的光神经元结构和包含该结构的神经网络处理系统能够实现神经网络的快速计算。

    一种用于流计算的FPGA网络及流计算系统与方法

    公开(公告)号:CN110069441A

    公开(公告)日:2019-07-30

    申请号:CN201910216953.4

    申请日:2019-03-21

    Abstract: 本发明涉及一种用于流计算的FPGA网络,该FPGA网络由多个FPGA通信连接而成,用于处理用户数据以获取处理结果,其中该FPGA包括:计算逻辑单元组模块,用于进行数据处理以获得中间结果;控制逻辑模块,用于将用户数据传输给该计算逻辑单元组模块,并根据路由表,将该中间结果传输至下一个FPGA,或将该中间结果作为处理结果传输至该FPGA网络出口;通信模块,用于进行该FPGA的外部数据传输。本发明采用软硬件相互协同的方式进行工作,可以充分发挖掘大数据计算数据流中的并行成分,发挥FPGA高并行度的计算优势,大大降低流计算的计算延迟,提高推荐系统、计算广告等大数据应用事务的反馈速度。

    一种面向基因比对算法的加速装置

    公开(公告)号:CN109785905A

    公开(公告)日:2019-05-21

    申请号:CN201811546046.8

    申请日:2018-12-18

    Abstract: 本发明提供了一种面向基因比对算法的加速装置。该加速装置包括主机端和多个加速模块,所述加速模块包括多个存储层、垂直切片管理单元和交换网络,其中:所述主机端用于控制向所述加速模块分发基因测序序列和接收基因比对结果;所述加速模块的存储层用于存储基因参考序列;所述加速模块的垂直切片管理单元用于管理将所述多个存储层进行垂直划分所形成的切片以及执行基因比对算法,获得基因比对结果;所述加速模块的交换网络用于控制该加速模块内部的数据交换以及该加速模块与外部的数据交换。本发明的加速装置利用定制结构能够提高基因比对算法的处理速度。

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