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公开(公告)号：CN103740824B
公开(公告)日：2015-07-29
申请号：CN201410009116.1
申请日：2014-01-09
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明提供了一种微量微生物鉴定的方法。通过两核苷酸同时加入到测序反应中，得到一系列峰谱信息图。在峰谱图中，不同模板所需的测序反应次数不同，且在不同的测序方式下得到的测序反应峰谱信号强度不同。通过这一原理可实现微生物菌群的鉴定。该方法有效提高了微生物鉴定的灵敏度、缩短了操作时间，为微生物的分离和鉴定提供了一种可靠的选择。
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公开(公告)号：CN102634587A
公开(公告)日：2012-08-15
申请号：CN201210128598.3
申请日：2012-04-27
Applicant: 东南大学
Abstract: DNA芯片组合延伸检测碱基连续突变的方法，已知一段核酸序列的待检样本中的至少一个单碱基的各种可能变化的确定是通过一个杂交到固定的样本核酸序列上的至少一个碱基延伸的组合检测来确定的。本发明的最大优点是实现了分析的序列片段中至少一个碱基变化的同时检测。由于序列是已知的，在没有4个核苷酸全部加入到延伸反应体系的情况下，引物会延伸到与没有加入的核苷酸互补的核苷酸单体前终止。基于这个原理，按照不同序列检测的具体情况，可以设计不同的延伸方法，将荧光标记过的核苷酸单体延伸到序列需要检测的碱基位置，从而获得待检测信息。
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公开(公告)号：CN104894246B
公开(公告)日：2018-03-20
申请号：CN201510262137.9
申请日：2015-05-21
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种两核苷酸合成测序分析多模板PCR产物的方法。该方法对同一PCR产物均匀分成至少两份，进行两核苷酸合成测序，每个测序反应得到包括两核苷酸种类及其核苷酸合成数目的测序编码信息，选择三组中至少两组不同两核苷酸合成循环测序分别得到的至少两组编码信息进行解码，最后通过关联分析确定PCR产物的不同DNA模板含量。本发明拓宽了单核苷酸合成测序的分析范围，适合多模板PCR产物、以及混合样本PCR产物的序列分析，可以直接测定样本中各个DNA模板的比例，也可以用于从大规模样本中寻找、筛选核酸标志物。
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公开(公告)号：CN104313168A
公开(公告)日：2015-01-28
申请号：CN201410605987.X
申请日：2014-10-30
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/101 , C12Q2565/301
Abstract: 本发明采用一种引物选择合成测序分析PCR产物单体型的方法对两个或者两个以上位点变化（如SNP，突变等）的PCR产物（多个DNA模板）进行单体型分析，PCR产物被特定测序引物杂交后分成两份，各自加入一种3’端封闭的单体试剂，测序引物在DNA模板指导下延伸位点发生变化的一个碱基后，该测序引物3’端被封闭而不能继续延伸，然后对未封闭的引物继续合成测序，得到特定DNA模板的序列信息,从而确定PCR产物的单体型。
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公开(公告)号：CN104894246A
公开(公告)日：2015-09-09
申请号：CN201510262137.9
申请日：2015-05-21
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种两核苷酸合成测序分析多模板PCR产物的方法。该方法对同一PCR产物均匀分成至少两份，进行两核苷酸合成测序，每个测序反应得到包括两核苷酸种类及其核苷酸合成数目的测序编码信息，选择三组中至少两组不同两核苷酸合成循环测序分别得到的至少两组编码信息进行解码，最后通过关联分析确定PCR产物的不同DNA模板含量。本发明拓宽了单核苷酸合成测序的分析范围，适合多模板PCR产物、以及混合样本PCR产物的序列分析，可以直接测定样本中各个DNA模板的比例，也可以用于从大规模样本中寻找、筛选核酸标志物。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN102634586A
公开(公告)日：2012-08-15
申请号：CN201210128597.9
申请日：2012-04-27
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 一种两核苷酸实时合成DNA解码测序方法，单个测序反应由X、Y两个不同的核苷酸同时进行，依据合成核苷酸数目与实时产生的检测分子数的定量关系，得到一个碱基序列片段编码XYn。整个测序包括对同一模板进行二组测序反应：每组测序由包含四个核苷酸dATP、dCTP、dGTP、dTTP，按照每个核苷酸在一个循环中只使用一次的方式，进行由两个不同核苷酸同时合成测序反应的循环，若干次测序反应后得到由一组按照测序顺序排列的若干XYn信息；当该组测序反应完成后，变性将测序引物延伸链清除，重新杂交测序引物，进行第二组测序反应，得到第二测序反应排列的若干XYn信息，最后通过解码二组按照测序顺序排列的若干XYn信息，组装出待测核酸片段的具体碱基序列。
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公开(公告)号：CN102634586B
公开(公告)日：2013-10-30
申请号：CN201210128597.9
申请日：2012-04-27
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 一种两核苷酸实时合成DNA解码测序方法，单个测序反应由X、Y两个不同的核苷酸同时进行，依据合成核苷酸数目与实时产生的检测分子数的定量关系，得到一个碱基序列片段编码XYn。整个测序包括对同一模板进行二组测序反应：每组测序由包含四个核苷酸dATP、dCTP、dGTP、dTTP，按照每个核苷酸在一个循环中只使用一次的方式，进行由两个不同核苷酸同时合成测序反应的循环，若干次测序反应后得到由一组按照测序顺序排列的若干XYn信息；当该组测序反应完成后，变性将测序引物延伸链清除，重新杂交测序引物，进行第二组测序反应，得到第二测序反应排列的若干XYn信息，最后通过解码二组按照测序顺序排列的若干XYn信息，组装出待测核酸片段的具体碱基序列。
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公开(公告)号：CN102344967A
公开(公告)日：2012-02-08
申请号：CN201110341269.2
申请日：2011-11-02
Applicant: 东南大学
Abstract: 一种缩短DNA模板的DNA测序方法及其应用，（1）采用合成或者连接测序方法将固定DNA模板中的一小段序列测定；（2）停止该测序引物的测序，并加入四种dNTPs单体延伸测序引物链，使DNA模板成为双链；（3）缩短DNA模板：用限制性内切酶处理预先设定包含酶识别序列的连接子，将已经测定的DNA模板中的一小段序列断裂；（4）将测序引物、且包含酶识别序列的双链寡核苷酸片段，连接到上述切割后的缩短DNA模板上；（5）变性，除去未固定的DNA链，重新获得DNA模板；（6）杂交测序引物，继续对固定DNA模板中的一小段序列进行测定；（7）重复步骤（2）到（6），直到未测定DNA模板序列测定完成。
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公开(公告)号：CN104313168B
公开(公告)日：2016-11-30
申请号：CN201410605987.X
申请日：2014-10-30
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明采用一种引物选择合成测序分析PCR产物单体型的方法对两个或者两个以上位点变化（如SNP，突变等）的PCR产物（多个DNA模板）进行单体型分析，PCR产物被特定测序引物杂交后分成两份，各自加入一种3’端封闭的单体试剂，测序引物在DNA模板指导下延伸位点发生变化的一个碱基后，该测序引物3’端被封闭而不能继续延伸，然后对未封闭的引物继续合成测序，得到特定DNA模板的序列信息,从而确定PCR产物的单体型。
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公开(公告)号：CN102344967B
公开(公告)日：2014-10-08
申请号：CN201110341269.2
申请日：2011-11-02
Applicant: 东南大学
Abstract: 一种缩短DNA模板的DNA测序方法及其应用，（1）采用合成或者连接测序方法将固定DNA模板中的一小段序列测定；（2）停止该测序引物的测序，并加入四种dNTPs单体延伸测序引物链，使DNA模板成为双链；（3）缩短DNA模板：用限制性内切酶处理预先设定包含酶识别序列的连接子，将已经测定的DNA模板中的一小段序列断裂；（4）将测序引物、且包含酶识别序列的双链寡核苷酸片段，连接到上述切割后的缩短DNA模板上；（5）变性，除去未固定的DNA链，重新获得DNA模板；（6）杂交测序引物，继续对固定DNA模板中的一小段序列进行测定；（7）重复步骤（2）到（6），直到未测定DNA模板序列测定完成。
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