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公开(公告)号:CN103164631B
公开(公告)日:2016-01-06
申请号:CN201310130664.5
申请日:2013-04-16
Applicant: 东华大学
IPC: G06F19/10
Abstract: 本发明公开了一种智能协同表达基因分析仪,包括基因芯片和单片机,利用基因芯片采集技术获取生物样本的基因表达谱,应用单片机嵌入式分析技术获取协同表达的基因集。单片机有四个模块组成:基因芯片表达谱读取模块;协同表达基因提取模块;存储模块;输出模块;协同表达基因提取模块的提取协同表达基因过程包含核函数选择、协同免疫克隆Memetic核双聚类算法、获取有重叠的双聚类和协同表达的基因集四部分。这种智能协同表达基因分析仪可从生物样本的基因表达谱中提取\表达趋势一致的基因集和反向表达相关的基因集。通过对这些共同表达基因的寻找,不仅可以对基因的功能研究给予提示,还可以对基因调控途径和调控网络的研究给予启发。
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公开(公告)号:CN103164631A
公开(公告)日:2013-06-19
申请号:CN201310130664.5
申请日:2013-04-16
Applicant: 东华大学
IPC: G06F19/10
Abstract: 本发明公开了一种智能协同表达基因分析仪,包括基因芯片和单片机,利用基因芯片采集技术获取生物样本的基因表达谱,应用单片机嵌入式分析技术获取协同表达的基因集。单片机有四个模块组成:基因芯片表达谱读取模块;协同表达基因提取模块;存储模块;输出模块;协同表达基因提取模块的提取协同表达基因过程包含核函数选择、协同免疫克隆Memetic核双聚类算法、获取有重叠的双聚类和协同表达的基因集四部分。这种智能协同表达基因分析仪可从生物样本的基因表达谱中提取\表达趋势一致的基因集和反向表达相关的基因集。通过对这些共同表达基因的寻找,不仅可以对基因的功能研究给予提示,还可以对基因调控途径和调控网络的研究给予启发。
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