本发明属于生物医学技术领域，具体涉及一种用于硫嘌呤类药物骨髓抑制风险预测的SNP位点组合及应用。本发明建立了一种全新的硫嘌呤类药物的个体化给药方案，该方案纳入了性别和5种基因型包括rs116855232、rs1142345、rs9465102、rs1735053、rs678560作为预测因子，建立了可视化的硫嘌呤类药物风险预测模型，所述风险预测模型具备良好的硫嘌呤类药物骨髓抑制风险预测性能，针对亚洲患者可将其区分为不同的风险人群，从而为临床提供更加个体化的药物剂量推荐，以有效避免硫嘌呤类药物骨髓抑制不良反应的发生。