本发明公开了一种基于多线程解算的地球振荡误差抑制方法及惯性导航系统，该方法包括以下步骤：惯性导航系统设置四路线程并开始进行对准；惯性导航系统上电n小时后，第一线程转入自主导航，输出第一线程导航结果；惯性导航系统上电n+6小时后，第二线程转入自主导航，输出第一线程和第二线程导航结果加权平均值；惯性导航系统上电n+12小时后，第三线程转入自主导航，输出第一线程、第二线程和第三线程导航结果加权平均值；惯性导航系统上电n+18小时后，第四线程转入自主导航，输出第一线程、第二线程、第三线程和第四线程导航结果加权平均值；导航结果是指地球振荡误差。本发明能够利用多线程自主导航结果实现地球振荡误差抑制。