本申请涉及有机合成技术领域，具体公开了一种2‑氯‑4‑甲氧基‑6‑甲硫基‑1,3,5‑三嗪的合成方法和应用。一种2‑氯‑4‑甲氧基‑6‑甲硫基‑1,3,5‑三嗪的合成方法，包括以下步骤：先将2,4,6‑三氯‑1,3,5‑三嗪加入甲醇中，再加入碳酸氢钠，搅拌混合，得到混合液；将甲硫醇加入‑10～0℃的混合液中，并在10～30℃搅拌反应2～3h，得到反应液；将冰水加入反应液中，静置，过滤收集固体，干燥，得到2‑氯‑4‑甲氧基‑6‑甲硫基‑1,3,5‑三嗪。本申请的2‑氯‑4‑甲氧基‑6‑甲硫基‑1,3,5‑三嗪可用于合成磺酰脲类除草剂，其具有易于降解，毒性低，活性高，成本低的特点。