本发明公开了一种柔性无人机抗侧风飞行控制方法，包括以下步骤：S1.建立柔性飞行器的飞行动力学方程；S2.采用二阶系统来模拟舵机的反应，建立舵机模型:选取Von Karman紊流模型，建立侧风模型；将状态空间形式的包含弹性模态的飞行动力学模型、舵机模型耦合，得到柔性无人机飞行动力学模型；S3.设计满足飞行品质要求、具有扰动抑制能力的静态输出反馈参数；S4.利用静态输出反馈参数，构造包含弹性模态的柔性无人机飞行动力学高阶系统的开环回路，设计外环回路成形控制器。本发明可以得到无人机阵风响应，为柔性无人机的抗侧风飞行控制提供了较为准确的依据。