本发明提供一种高效的UDS诊断系统及方法，所述UDS诊断系统用于汽车ECU诊断，所述UDS诊断系统包括数据获取模块、数据筛分模块、数据传输模块以及处理模块，所述数据获取模块用于获取ECU内个功能单元的的运行数据，所述数据筛分模块用于对运行数据进行筛分，所述数据传输模块用于将运行数据传输至处理模块，所述处理模块用于对运行数据进行诊断，所述数据获取模块包括第一获取单元，所述第一获取单元用于获取ECU内故障存储器内的故障数据，本发明能够针对ECU中的数据进行分类，并且有针对性的进行诊断，能够极大的降低无用的诊断过程，以解决现有的诊断过程效率和有效性较低的问题。