本发明属于花生肽技术领域，具体涉及一种含有花生肽的组合物及其制备方法和应用。本发明每100ml花生肽组合物包括以下原料：花生肽5～10g、番石榴汁3～8g、苹果汁3～8g、梨汁3～8g、柠檬酸0.05～0.1g、水苏糖1～7.5g、三氯蔗糖0.1～1.5g、麦芽糊精0.2～0.5g、果胶0.2～0.5g和纯化水余量。本发明含有花生肽的组合物具有色泽一致、无沉淀，无苦味，口感细腻、酸甜适中、呈浓郁的花生肽和水果清香的优势，且营养丰富。