本发明涉及一种任意阶分段多项式信号的处理方法，以解决现有分段多项式信号分割效果差的问题。本发明提供一种任意阶分段多项式信号的处理方法：首先，从原子力显微镜或从高通量基因组测序仪中提取信号；然后按照函数模型对信号进行分割拟合，再通过计算机算法程序进行动态规划和矩阵分解，根据输出分割值位置，绘制分割拟合后的新信号；最后，根据新信号检测断点位置，分割出伸直长度及持续长度估计所需要的合适区域，完成蛋白质解折叠，或分割出杨氏模量估计所需要的合适区域，或检测拷贝数变异区间及变异类型。