本申请公开了一种心肺音信号的分离方法、装置、设备及计算机可读存储介质，该方法包括采集心肺音时域信号，并将心肺音时域信号转换为心肺音时频域信号；然后根据预设规则对心肺音时频域信号进行分解，得到心肺音时频域信号的基矩阵和系数矩阵；利用心肺音信号的先验知识设置标签矩阵，并利用带标签的非负矩阵分解方法对心肺音时频域信号进行分解，得到心音参考矩阵和肺音参考矩阵；分别利用心音参考矩阵和肺音参考矩阵对基矩阵和系数矩阵进行聚类分类，并根据分类结果计算出心音时频域矩阵和肺音时频域矩阵；再分别对心音时频域矩阵和肺音时频域矩阵进行重构，并转换为心音信号和肺音信号，从而提高分离心音信号和肺音信号的准确度和精度。