本发明公开了一种黄瓜紫黄质脱氧环化酶基因启动子及其应用。本发明所提供的启动子为如下1)-3)中任一种：1)序列表中序列1所示的DNA分子；2)在严格条件下与1)限定的DNA序列杂交，且具有启动子功能的DNA分子；3)与1)或2)限定的DNA序列具有90％以上同源性，且具有启动子功能的DNA分子。本发明公开了黄瓜紫黄质脱环氧化酶基因启动子的序列，实验证实该启动子是一个在植物绿色组织中高效特异性表达的启动子，主要在进行光合作用的绿色植物组织，如叶片中启动目的基因的表达，这对于进一步研究植物光合作用相关分子生物学信息具有非常重要的意义。