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公开(公告)号：CN115948582A
公开(公告)日：2023-04-11
申请号：CN202211341770.3
申请日：2022-11-02
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12R1/63
Abstract: 本发明提供一种基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法及应用，包括：(1)取急性肝胰腺坏死病致病质粒中，长度1665bp的pirAB序列作为检测靶基因，设计并筛选RT‑ERA引物组和RT‑ERA荧光型探针；(2)以待测样品的基因组DNA为模板，用设计的RT‑ERA引物组和探针，在33℃‑42℃下恒温RT‑ERA扩增，RT‑ERA扩增产物，检测荧光信号强度，根据15min内的扩增曲线的荧光信号值，判断扩增结果；本发明利用实时定量酶促重组扩增技术RT‑ERA建立AHPND检测体系，可在33℃‑42℃下高效扩增，20min内即可得到检测结果，具有较高的特异性且检出限大大降低，操作更加简便。
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公开(公告)号：CN117143818A
公开(公告)日：2023-12-01
申请号：CN202311385866.4
申请日：2023-10-25
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
Abstract: 本发明涉及一种提取海洋鱼脑或皮肤色素细胞组织细胞核的方法，属于细胞核提取技术领域。本发明所要解决的技术问题提供一种提取海洋鱼脑或皮肤色素细胞组织细胞核的方法。该方法包括如下步骤：a、组织裂解及细胞核释放：取海洋鱼的组织，加入NE buffer溶液后，捣碎匀浆，然后过细胞筛，所得溶液进行离心；b、细胞核洗涤：a步骤离心后的产物去除上清液，用Wash buffer溶液洗涤沉淀，离心分离，得到细胞核。本发明方法，能够在较短时间内从海洋鱼类脑组织中成功分离提取大量较为纯净的完整的细胞核，且操作过程简单，无需特殊仪器设备，利用离心机及显微镜等常见实验室仪器即可完成细胞核提取过程，整个过程用时短，具有较强的实用性。
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公开(公告)号：CN117106698B
公开(公告)日：2024-01-26
申请号：CN202311377572.7
申请日：2023-10-24
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
Abstract: 本发明涉及海洋鱼类肝、鳃组织细胞核的提取方法，属于细胞核提取技术领域。本发明解决的技术问题是提供一种海洋鱼类肝、鳃组织细胞核的提取方法。该方法包括以下步骤：S1、组织裂解：取海洋鱼类的组织，加入NE1裂解液中破碎并裂解，得到浑浊液；S2、细胞核释放：用细胞筛将S1步骤得到的浑浊液过滤，滤液离心，得到沉淀；S3、细胞核洗涤：用洗涤缓冲液洗涤S2步骤得到的沉淀，得到海洋鱼类组织细胞核。本发明方法，能够在较短时间内从海洋鱼类肝组织或鳃组织中成功分离提取大量较为纯净的完整的细胞核，且操作过程简单，无需特殊仪器设备，利用离心机及显微镜等常见实验室仪器即可完成细胞核提取过程，整个过程用时短，具有较强的实用性。
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公开(公告)号：CN115820936B
公开(公告)日：2023-12-19
申请号：CN202211367931.6
申请日：2022-11-03
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明提供一种基于ERA技术的十足目虹彩病毒1可视化快速检测方法及检测用引物和探针。本发明以十足目虹彩病毒1的ATP酶基因作为检测靶基因，设计合成引物和探针，并进行ERA检测，根据ERA扩增产物的荧光信号即可判断检测结果。本发明实验操作简单，耗时短速度快，检测灵敏度和特异性高，灵敏度可达1.0×100copies/μL，且结果可视化。
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公开(公告)号：CN113789391A
公开(公告)日：2021-12-14
申请号：CN202110824311.X
申请日：2021-07-07
Applicant: 中国海洋大学 , 中国海洋大学三亚海洋研究院
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6806 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种仿刺参育种全基因组50KSNP芯片及应用，包括(1)仿刺参全基因组范围的50kSNP芯片的开发：通过构建仿刺参样品群体，全基因组范围的SNP分型，对仿刺参50KSNP标记筛选，HD‑marker高密度芯片的设计和开发探针的设计进而获得48K位点的液相芯片池；(2)测试芯片的准确性和分型效果，通过DNA样品质量检测，HD‑Marker芯片检测并对结果进行分析确保其具有较高的准确性和较好的分型效果，本芯片可应用于仿刺参全基因组育种芯片在不同群体仿刺参的遗传背景分析、仿刺参性状关联分析。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113684280A
公开(公告)日：2021-11-23
申请号：CN202110768559.9
申请日：2021-07-07
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6837 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种仿刺参抗高温育种低密度12KSNP芯片及应用，包括(1)仿刺参全基因组范围的12KSNP芯片的开发：通过构件仿刺参抗高温群体，全基因组范围的SNP分型，对仿刺参12KSNP标记筛选，HD‑marker高密度芯片的设计和开发探针的设计进而获得12K位点的液相芯片池；(2)测试芯片的准确性和分型效果；本芯片可应用于仿刺参抗高温性状分子育种中的不同地理群体遗传背景分析、抗高温性状遗传力估计的应用以及抗高温性状的全基因组选择育种值分析(GS)。
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公开(公告)号：CN119920316A
公开(公告)日：2025-05-02
申请号：CN202510408809.6
申请日：2025-04-02
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种基于表观注释信息筛选分子标记进行全基因组选择育种的方法，包括以下步骤：步骤A：对凡纳滨对虾育种群体进行生长性状的表型测定和基因组测序，获得表型数据和SNP分型数据；步骤B：利用表型数据和SNP分型数据进行GS分析，通过主流育种模型预测育种群体的基因组育种值，筛选出最优育种模型；步骤C：利用最优育种模型结合关键组蛋白修饰区域通过ChromHMM分析进行染色质状态的分类，筛选出具有关键组蛋白修饰区域的功能性SNPs。这些SNPs具有较强功能关联性，用于不同地域群体，能够在相同的预测准确性下，利用更少的SNPs数量，为养殖动物的生长性状遗传解析提供更精确的分子标记，显著提升遗传育种值估计的准确性及跨群体效果，加速育种进程。
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公开(公告)号：CN116200539A
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202211632464.5
申请日：2022-12-19
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12R1/93
Abstract: 本发明提供一种基于ERA技术的传染性皮下及造血组织坏死病毒快速检测方法，该方法包括以下步骤：(1)选取传染性皮下及造血坏死病毒的保守区域ORF1区段1936‑2244nt作为检测靶位点，设计合成引物；其中，上游引物的序列如SEQ ID NO:5所示，下游引物的序列如SEQ ID NO:6所示；(2)以待测样品的基因组DNA为模板，采用步骤(1)的引物进行基础型ERA检测或荧光型ERA检测，得到ERA扩增产物；根据ERA扩增产物荧光信号判断检测结果。本发明实验操作简单，耗时短，速度快，可特异性的检测传染性皮下及造血组织坏死病毒，且灵敏度高，灵敏度可达101copies/μL。
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公开(公告)号：CN115852006A
公开(公告)日：2023-03-28
申请号：CN202211648290.1
申请日：2022-12-21
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/6893 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明提出了基于ERA技术的对虾肝肠胞虫快速检测方法及引物与探针组合，包括一对ERA特异性引物和一条特异性荧光探针，所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示，所述探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示。本发明建立的ERA技术的对虾肝肠胞虫快速检测方法，可以明显缩短对虾肝肠胞虫的检测时间；同时操作简单，灵敏度高、特异性强，可满足快速检测的需求，且检测成本低。
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公开(公告)号：CN119899901A
公开(公告)日：2025-04-29
申请号：CN202510408469.7
申请日：2025-04-02
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , G16B25/10 , G16B20/20 , G16B20/30 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用表观注释信息进行凡纳滨对虾经济性状相关分子标记筛选及育种的方法，包括以下步骤：步骤A：对凡纳滨对虾育种群体进行生长性状的表型测定和基因组测序，获得表型数据和SNP分型数据；步骤B：利用表型数据和SNP分型数据进行GWAS分析，获得每个SNP的P值；步骤C：利用每个SNP的P值经过Bonferroni多重校正方法，以P值
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