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公开(公告)号:CN108779459B
公开(公告)日:2022-09-09
申请号:CN201680077963.9
申请日:2016-11-08
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12N15/11 , C12Q1/6895 , C40B40/06
Abstract: 一种棉花全基因组SNP芯片及其应用,所述芯片命名为CottonSNP80K,包含82,259个SNP位点(SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:82,259),主要基于陆地棉种内SNP变异定制,非常适于陆地棉种内基因分型检测,可大大克服陆地棉种内遗传基础狭窄,遗传多样性低的瓶颈。该芯片可以对陆地棉品种资源进行分子标记指纹分析,品种纯度和真实性鉴定,育种材料遗传背景的分析和筛选、农艺性状重要基因位点关联分析等。同时,该芯片也将有效用于海岛棉等其他棉种的种内及种间基因分型分析。
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公开(公告)号:CN106947771B
公开(公告)日:2021-02-12
申请号:CN201710171565.X
申请日:2017-03-22
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12N15/29 , C12N15/11 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一个棉花产量性状关联的乙烯信号转导途径调节因子。乙烯信号转导途径调节因子GhEIL,所述的乙烯信号转导途径调节因子GhEIL在四倍体陆地棉TM‑1中的cDNA序列为:SEQ ID NO.1,基因组序列为:SEQ ID NO.2,所述的乙烯信号转导途径调节因子GhEIL在基因组序列的184bp位置上存在一个SNP突变,该SNP突变与棉花产量性状之间的存在显著的相关性,SNP位点的碱基从A变为C,对应的氨基酸从Asn变为His;该位点碱基为C的型产量显著高于该位点碱基为A的基因型。该基因在高效鉴定高产陆地棉品种、改良棉花产量性状和培育棉花高产新品种中具有重要的研究价值和应用前景。
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公开(公告)号:CN107058338B
公开(公告)日:2021-01-19
申请号:CN201710171581.9
申请日:2017-03-22
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12N15/29 , C12N15/11 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一个棉花产量性状关联的乙烯响应转录因子基因。乙烯响应转录因子基因GhAIL6,在所述的乙烯响应转录因子基因GhAIL6在四倍体陆地棉TM‑1中的cDNA序列为:SEQ ID NO.1,基因组序列为:SEQ ID NO.2;基因GhAIL6含有两个非同义突变的SNP位点,分别在基因组序列的672bp和703bp位置上,这两个SNP基因型紧密连锁;第一个SNP位点碱基从A变为G;第二个SNP位点碱基从G变为A;突变后的基因型衣分和产量显著高于野生型。该基因在高效鉴定高产陆地棉品种、改良棉花产量性状和培育棉花高产新品种中具有重要的研究价值和应用前景。
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公开(公告)号:CN110551734A
公开(公告)日:2019-12-10
申请号:CN201910871799.4
申请日:2019-09-16
Abstract: 本发明公开了陆地棉纤维强度基因GhUBX及其应用。来自四倍体陆地棉纤维强度基因GhUBX,四倍体陆地棉Prema中该基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,在四倍体陆地棉86-1中该基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明所克隆的基因与棉纤维的品质有着直接的联系。构建的植物反义表达载体和超表达载体对陆地棉W0进行转基因研究,结果发现UBX蛋白含量增多会导致纤维螺旋增强,降低会导致纤维的螺旋减弱。本发明所述的超表达载体可在增加棉花纤维螺旋程度,提高棉花纤维强度中应用。本发明所述的反义表达载体可在增厚棉花纤维次生壁,提高棉花纤维强度中的应用。
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公开(公告)号:CN107058485A
公开(公告)日:2017-08-18
申请号:CN201611239213.5
申请日:2016-12-28
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一个能显著提高海岛棉铃重的陆地棉染色体片段及其SSR标记引物和应用。一个能显著提高海岛棉铃重的陆地棉染色体片段A1‑6,此陆地棉染色体片段A1‑6来自于陆地棉品种TM‑1,通过4个SSR标记:BNL2440185,NAU2437235,NAU3901245,dPL0526260标记;使用所述的4个SSR标记引物扩增陆地棉品种TM‑1基因组DNA,同时含有4个分子标记目的片段的染色体片段即为陆地棉染色体片段A1‑6。本发明所述IL‑A1‑6的陆地棉染色体片段及其分子标记应用于棉花分子育种,能极大地增加棉花铃重,提高棉花的产量和育种效率。
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公开(公告)号:CN107058338A
公开(公告)日:2017-08-18
申请号:CN201710171581.9
申请日:2017-03-22
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一个棉花产量性状关联的乙烯响应转录因子基因。乙烯响应转录因子基因GhAIL6,在所述的乙烯响应转录因子基因GhAIL6在四倍体陆地棉TM‑1中的cDNA序列为:SEQ ID NO.1,基因组序列为:SEQ ID NO.2;基因GhAIL6含有两个非同义突变的SNP位点,分别在基因组序列的672bp和703bp位置上,这两个SNP基因型紧密连锁;第一个SNP位点碱基从A变为G;第二个SNP位点碱基从G变为A;突变后的基因型衣分和产量显著高于野生型。该基因在高效鉴定高产陆地棉品种、改良棉花产量性状和培育棉花高产新品种中具有重要的研究价值和应用前景。
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公开(公告)号:CN103571852B
公开(公告)日:2016-01-13
申请号:CN201310398063.2
申请日:2013-09-05
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一个能显著增加陆地棉衣分的海岛棉染色体片段及其SSR标记。所述的海岛棉染色体片段D1‐3来自于海岛棉品种海7124,位于棉花染色体组的D1号染色体,通过4个SSR标记:NAU3576,NAU5172,BNL3090,NAU2573标记;使用所述的4各SSR标记引物扩增海岛棉品种海7124基因组DNA,同时含有4个分子标记位点的染色体片段即为海岛棉染色体片段D1-3。含有该片段的染色体片段导入系其衣分为39.22%‐45.08%,比对照陆地棉遗传标准系TM‐1的衣分31.81%。本发明海岛棉染色体片段及其分子标记应用于棉花分子育种,能极大地增加棉花衣分,提高棉花的产量和育种效率。
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公开(公告)号:CN103509861B
公开(公告)日:2015-05-13
申请号:CN201310350208.1
申请日:2013-08-12
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明属于分子育种领域,涉及一种通过聚合染色体片段导入系同步改良棉花纤维长度、强度和细度的分子育种方法。以IL080-D6-1和1047(IL019‐A2‐6染色体片段导入系)2个导入系为非轮回亲本分别和轮回亲本(新疆0768),进行杂交1次,回交2代,在BC2F1将含不同染色体片段的株系间互交,得到双片段聚合的F2分离群体,通过2个片段上的各2个分子标记鉴定出双片段纯合的单株,进行四环镜的田间试验,并继续自交2代得到双片段纯合且纤维长度、纤维强度和细度得到极显著改良的棉花新品系。利用这一方法,已经培育出优质、高产的棉花新品系“南农08‐66”。
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公开(公告)号:CN103571852A
公开(公告)日:2014-02-12
申请号:CN201310398063.2
申请日:2013-09-05
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一个能显著增加陆地棉衣分的海岛棉染色体片段及其SSR标记。所述的海岛棉染色体片段D1‐3来自于海岛棉品种海7124,位于棉花染色体组的D1号染色体,通过4个SSR标记:NAU3576,NAU5172,BNL3090,NAU2573标记;使用所述的4各SSR标记引物扩增海岛棉品种海7124基因组DNA,同时含有4个分子标记位点的染色体片段即为海岛棉染色体片段D1-3。含有该片段的染色体片段导入系其衣分为39.22%‐45.08%,比对照陆地棉遗传标准系TM‐1的衣分31.81%。本发明海岛棉染色体片段及其分子标记应用于棉花分子育种,能极大地增加棉花衣分,提高棉花的产量和育种效率。
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