用于通过细菌的宏基因组分析诊断肺癌的试剂盒和方法

    公开(公告)号:CN108265115A

    公开(公告)日:2018-07-10

    申请号:CN201710770882.3

    申请日:2017-08-31

    Inventor: 金润根 全成圭

    CPC classification number: C12Q1/6895 C12Q2531/113 C12Q1/689 C12Q1/686

    Abstract: 本发明涉及用于通过细菌的宏基因组分析诊断肺癌的试剂盒和方法。提供了通过细菌的宏基因组分析提供肺癌诊断的信息的试剂盒,更具体地涉及用于经由使用来源于受试者的样品的细菌的宏基因组分析通过分析来源于特异性细菌的细胞外囊泡的含量的增减来预测患肺癌的风险或诊断肺癌的试剂盒。环境中的细菌分泌的EV吸入人体,会直接影响癌症发生,因难以在出现症状之前对肺癌早期诊断,故难以治疗。依本公开可通过使用来源于人体的样品对来源于细菌的EV的宏基因组分析来预测肺癌,导致对患肺癌的高风险组的早期诊断和预测,故可延迟肺癌的发作或可通过适当控制预防肺癌,且即使在肺癌发生后也可实现对肺癌的早期诊断,降低疾病发生率并提高治疗效果。

    与黄热病病毒EDIII特异性结合的DNA适体及其用途

    公开(公告)号:CN113227377B

    公开(公告)日:2023-11-28

    申请号:CN201980083915.4

    申请日:2019-12-18

    Inventor: 金润根 潘沧一

    Abstract: 本发明涉及一种特异性结合黄热病病毒包膜蛋白结构域III(YFV EDIII)的DNA适体、包含所述DNA适体的用于诊断黄热病的组合物、诊断黄热病的试剂盒、诊断黄热病的生物传感器及提供用于诊断黄热病的信息的方法。作为本发明人为开发用于诊断黄热病的新型生物标志物而进行的正式研究的结果,已证实对YFV EDIII具有特异性结合能力的DNA适体具有与YFV EDIII的强结合力和优异的特异性。因此,预期与使用现有抗体的ELISA法相比,本发明具有更高的稳定性,因此预期可有效地用于开发诊断黄热病的组合物、诊断黄热病的生物传感器和提供用于诊断(56)对比文件Bruno J 等.Development, screening,and analysis of DNA aptamer librariespotentially useful for diagnosis andpassive immunity of arboviruses《.BMCResearch Notes》.2012,第5卷(第1期),633.Shaun P.Falk等.Aptamer DisplacementScreen for Flaviviral RNAMethyltransferase Inhibitors《.SLASDiscovery》.2014,第19卷(第8期),第1147-1153页.刘腾飞等.核酸适体的筛选制备及分析应用《.生物技术通报》.2013,(第4期),第39-48页.师永霞等.黄热病病毒的实时荧光RT-PCR检测方法研究《.中国卫生检验杂志》.2009,第19卷(第5期),第1003-1006页.

    通过细菌性宏基因组分析来诊断中风的方法

    公开(公告)号:CN111727263B

    公开(公告)日:2023-11-28

    申请号:CN201980013262.2

    申请日:2019-02-11

    Inventor: 金润根

    Abstract: 本发明涉及通过细菌性宏基因组分析来诊断中风的方法,并且更具体地,涉及通过对来源于受试者的样品进行细菌性宏基因组分析以分析来源于特定细菌的细胞外囊泡的含量的波动来诊断中风的方法。由环境中存在的细菌分泌的细胞外囊泡被吸收到体内并且会对炎症响应有直接影响。中风在在显示症状之前在其早期阶段难以诊断,因此难以有效治疗。根据本发明,通过使用来源于人的样品经由对来源于细菌的细胞外囊泡的宏基因组分析,可以预先预测中风的发病风险,使得可以诊断和预测中风风险组,从而通过适当管理延迟或预防疾病的发生。甚至在疾病发作后也可以进行早期诊断,从而减少中风的(56)对比文件Jia Yin 等.Dysbiosis of GutMicrobiota With Reduced Trimethylamine-N-Oxide Level in Patients With Large-ArteryAtherosclerotic Stroke or TransientIschemic Attack《.J Am Heart Assoc》.2015,第4卷(第11期),Jin-Young Park et al.MetagenomeAnalysis of Bodily Microbiota in a MouseModel of Alzheimer Disease UsingBacteria-derived Membrane Vesicles inBlood《.Experimental Neurobiology》.2017,第26卷(第06期),Dayle Johnston et al.Illumina MiSeq16S amplicon sequence analysis of bovinerespiratory disease associated bacteriain lung and mediastinal lymph nodetissue《.BMC Veterinary Research》.2017,第13卷(第01期),

    通过细菌性宏基因组分析来诊断胆管癌的方法

    公开(公告)号:CN111630189B

    公开(公告)日:2023-09-22

    申请号:CN201980009542.6

    申请日:2019-01-18

    Inventor: 金润根

    Abstract: 本发明涉及通过细菌宏基因组分析诊断胆管癌的方法,更具体涉及通过使用来源于受试者的样品经过细菌宏基因组分析来分析来源于特定细菌的细胞外囊泡的含量的增加或减少来诊断胆管癌的方法。环境中存在的细菌分泌的细胞外囊泡会被吸收到体内,并直接影响癌症的发生,胆管癌很难在症状出现之前及早诊断,使得难以有效治疗。因此,通过使用根据本发明的来源于人的样品,经由对细菌的细胞外囊泡的宏基因组分析,事先对胆管癌发生的风险进行分析,可早期诊断并预测胆管癌的风险组,以通过适当的处理延迟或预防胆管癌的发作,甚至在发病后也可进行早期诊断,从而减少了胆管癌的发生率并提高了治疗效果。另外,通过对诊断为胆管癌的患者进行宏基因组分析,避免暴露于致病因子,可改善癌症的进展或预防癌症的复发。

    通过细菌宏基因组分析来诊断阿尔茨海默氏症的方法

    公开(公告)号:CN111417732B

    公开(公告)日:2023-09-22

    申请号:CN201880066002.7

    申请日:2018-09-13

    Abstract: 本发明涉及一种通过细菌宏基因组分析诊断阿尔茨海默氏症的方法,更具体地,涉及通过使用来源于正常人和受试者的样品进行宏基因组分析来分析特定细菌的细胞外囊泡含量的增加或减少来诊断阿尔茨海默氏症和轻度认知障碍的方法。环境中存在的细菌分泌的细胞外囊泡被人体吸收,渗透到脑组织中,从而直接影响诸如阿尔茨海默氏症等认知功能,并且因为阿尔茨海默氏症难以在症状显现之前早期诊断,因此使得有效治疗困难。因此,通过根据本发明,使用来源于人体的样品,对细菌的细胞外囊泡进行宏基因组分析来预先预测轻度认知障碍和阿尔茨海默氏症发作的风险,可早期诊断和预测阿尔茨海默氏症风险群体以利用适当的治愈延迟该疾病发作的时间或防止该疾病发作,并且在该疾病发作之后,可进行早期诊断,从而降低阿尔茨海默氏症的发生率并提高治疗效果。

    包含源自藤黄微球菌的胞外囊泡的用于预防或治疗眼病的组合物

    公开(公告)号:CN116710070A

    公开(公告)日:2023-09-05

    申请号:CN202180088056.5

    申请日:2021-10-19

    Inventor: 金润根

    Abstract: 本发明涉及一种用于预防、缓解或治疗眼病的组合物,该组合物包括源自藤黄微球菌的囊泡作为活性成分。发明人证实,当囊泡口服时,囊泡通过血脑屏障(BBB)被递送到包括视网膜在内的中枢神经系统。此外证实,当上皮细胞和巨噬细胞用囊泡处理时,不仅大大抑制了生物致病因子对炎症介质的分泌,而且还抑制了生物致病因子的NLRP3蛋白表达。此外证实,当对具有由氧化应激引起的眼病的兔子模型施用囊泡时,由氧化应激引起的视网膜变性得到显著抑制,因此,根据本发明的源自藤黄微球菌的囊泡不仅能够用于预防、缓解或治疗年龄相关性眼病和炎症性眼病的组合物,而且还能够有效地用于开发预防、缓解或治疗年龄相关性眼病和炎症性眼病的药物或保健功能食品。

    来源于罗斯氏菌属细菌的纳米囊泡及其用途

    公开(公告)号:CN113474470A

    公开(公告)日:2021-10-01

    申请号:CN202080014308.5

    申请日:2020-02-04

    Inventor: 金润根

    Abstract: 本发明涉及来源于罗斯氏菌属细菌的囊泡及其用途。发明人已经通过实验证实了在从患有糖尿病、心房颤动、心肌病、肝癌、肝硬化、痴呆、抑郁症、帕金森病和特应性皮炎的患者获得的临床样品中的囊泡与正常个体相比显著减少,并且当施用从菌株中分离的囊泡时,由病原囊泡(例如来源于大肠杆菌的囊泡)引起的炎症性介质的分泌被显著抑制,且来源于罗斯氏菌属细菌的囊泡显著抑制应激激素引起的脑神经细胞损伤,并且因此,根据本发明的来源于罗斯氏菌属细菌的囊泡可有效地用于开发诊断糖尿病、心房颤动、心肌病、肝癌、肝硬化、痴呆、抑郁症、帕金森病和特应性皮炎的方法以及开发用于预防或治疗糖尿病、心血管疾病、肝脏疾病、脑神经疾病和炎症性疾病的组合物。

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