一种基于卷积神经网络的核小体分类预测方法

    公开(公告)号:CN107545153B

    公开(公告)日:2021-06-11

    申请号:CN201711011644.0

    申请日:2017-10-25

    Abstract: 本发明公开了一种基于卷积神经网络的核小体分类预测方法,其特征是,包括如下步骤:1)特征提取;2)提取核小体或链接体DNA序列中核苷酸的物理化学属性;3)添加生物特性;4)获取第24维向量;5)添加核苷酸化学性质;6)得到包含生物信息的矩阵;7)构建卷积神经网络结构;8)分类核小体。这种方法能精准预测核小体的分类。

    一种细菌中DNA转录终止子的预测方法

    公开(公告)号:CN110379464A

    公开(公告)日:2019-10-25

    申请号:CN201910688863.5

    申请日:2019-07-29

    Abstract: 本发明公开了一种细菌中DNA转录终止子的预测方法,包括如下步骤:1)获取细菌的终止子和非终止子序列作为基准数据集和独立数据集;2)特征集提取;3)特征集排序;4)特征集选择;5)特征集提取方法对比;6)训练模型;7)构建组合分类器;8)方法评估。这种预测方法可以提取多种DNA信息中的特征,还减少了计算时间,避免出现过拟合现象,同时还可以选出最优的分类模型,提高了预测终止子预测的准确率。

    一种基于聚类下采样和可解释深度森林的脑卒中预测方法

    公开(公告)号:CN118800452A

    公开(公告)日:2024-10-18

    申请号:CN202410993056.5

    申请日:2024-07-24

    Abstract: 本发明公开了一种基于聚类下采样和可解释深度森林的脑卒中预测方法,获取脑卒中和正常患者的代谢指标以及分类情况;对特征进行标准化,并对异常值进行处理,获取完整的、标准化数据;使用提出的CBUC算法对不平衡数据重采样,尽可能多地将多类型的数据纳入训练,得到一个平衡训练集;使用级联深度森林模型(DF)对数据集进行预测;采用Grid search技术对预测的模型进行优化;采用10折交叉验证对模型的性能进行评估,使用Specificity(SP)、Sensitivity(SE)、Gmean、Area Under the Curve(AUC)以及Accuracy(ACC)五个指标衡量模型性能;计算深度模型中第一层森林的MDI,对输入的特征进行重要性比较。该方法将极度不平衡脑卒中数据重采样为平衡数据集,提高模型的预测精度,同时兼具可解释性,相比于最先进的方法具有更优越的识别性能且预测过程更加透明。

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