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公开(公告)号:CN117051136A
公开(公告)日:2023-11-14
申请号:CN202211690104.0
申请日:2022-12-27
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/32
Abstract: 本发明属于生物技术领域,具体涉及一种结核分枝杆菌复合群鉴定及耐药检测引物组。本发明基于宏基因组测序技术对临床疑似结核病的样本进行大规模测序,分析阳性样本的MTB高频、特异性的核酸序列,识别多个新的MTB鉴定的生物标志区域及耐药区域的碱基分布特征。本发明应用这些MTBC特征区域设计一套结核分枝杆菌复合群鉴定及主要耐药基因检测的引物组,可实现同时鉴定结核分枝杆菌复合群并检测主要耐药突变,具有高特异性,高灵敏度的特点。
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公开(公告)号:CN116665777A
公开(公告)日:2023-08-29
申请号:CN202310544947.8
申请日:2023-05-15
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司
Abstract: 本申请公开了基于引物模板结合能力的引物设计方法、系统及存储介质,方法包括:获取靶序列;将靶序列划分为多个靶单元,对每个靶单元中的序列进行相似度分析,获得相应的多序列比对结果;根据多序列比对结果,采用隐马尔科夫模型、引物模板结合能力矩阵和错配信息矩阵筛选每个靶单元中的候选引物;对候选引物进行筛选,得到候选引物对;利用候选引物对建立引物池。通过总结关键的位置、数量信息以及错配类型,并将这些信息数字化,以辅助引物的设计,相较于现有的引物设计方法,本申请在牺牲很少的靶向序列覆盖度的前提下获得了更优的引物设计。
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公开(公告)号:CN116497104A
公开(公告)日:2023-07-28
申请号:CN202310595228.9
申请日:2023-05-25
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/689 , G16B20/20 , C12R1/19
Abstract: 本发明属于质量控制技术领域,涉及一种实验室标准菌株的质量控制评估方法及系统。本方法从标准菌株污染评估、标准菌株基因覆盖评估、标准菌株基因组组装质量评估、标准菌株耐药基因差异评估和标准菌株基因组变异评估这5个方面对标准菌株进行打分,辅助进化关系评估验证标准菌株的可用性,并可选地辅助生化鉴定检测,从而快速准确地实现菌株质量评估,完善标准菌株管理体系。
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公开(公告)号:CN116206685A
公开(公告)日:2023-06-02
申请号:CN202310177710.0
申请日:2023-02-28
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: G16B25/20 , C12Q1/6806
Abstract: 本申请公开了基于核酸一致性的引物设计方法、系统及计算机存储介质,方法包括:获取靶向核酸序列;对靶向核酸序列进行分类,获得多个分类单元;将每个分类单元中的至少一条靶向核酸序列作为代表序列;设计代表序列的候选引物;依次选择每个分类单元的至多一对候选引物,建立候选引物池;将候选引物池中存在非特异性扩增的候选引物排除,获得最终的引物池。本申请操作简单,而且可以处理大量的核酸库,尤其适合针对病原体库的通用引物设计。相比同类软件本申请的方法更加系统全面,设计出的引物池覆盖度高且宿主污染率低。
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公开(公告)号:CN114592036B
公开(公告)日:2023-03-31
申请号:CN202210351202.5
申请日:2022-04-02
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明提供了一种放线菌核酸提取检测试剂、试剂盒及其方法和应用,所述提取检测试剂含有InstaGeneMatrix、Tris‑HCl、SDS、KCl和EDTA,本发明能够实现快速高效提取结核分枝杆菌核酸DNA,将结核分枝杆菌的提取检测限提高到8拷贝数/ml;从复杂样本中亦能快速高效提取到结核分枝杆菌核酸,验证了本提取方法潜在的临床适用性。
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公开(公告)号:CN115732031A
公开(公告)日:2023-03-03
申请号:CN202111000227.2
申请日:2021-08-27
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: G16B20/30
Abstract: 本申请涉及一种测序数据背景噪音剔除的生信分析方法和系统。本方法基于“待测样本与生信对照之间形成的隐藏亚组”,对样本中组分之间的连接进行分析,从而实现在最大程度保留真实信号前提下,更加有效剔除引入的噪音信号。本申请不依赖于任何对待测真实信号和噪音信号的先验知识,即可高效去除噪音。
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公开(公告)号:CN115578730A
公开(公告)日:2023-01-06
申请号:CN202211097467.3
申请日:2022-09-08
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司
IPC: G06V30/148 , G06V30/164
Abstract: 本发明公开了一种测序仪监控方法及系统,方法包括:获取测序仪屏幕的显示内容图像;采用OCR技术识别显示内容图像中的字符,获得相应的显示内容文本;分析显示内容文本代表的测序仪的工作状态;根据工作状态向管理人员发送相应的提醒信息。本发明采用自动化的监控方法对测序仪进行监控,无需安排人员值守,人员只需在收到异常提醒后到达现场处理即可,大大解放了生产力。
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公开(公告)号:CN114400048A
公开(公告)日:2022-04-26
申请号:CN202111643877.9
申请日:2021-12-30
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
Abstract: 本发明提供了一种鉴定细菌质粒基因组及其特征图谱的综合性方法,所述方法筛选出候选的质粒序列并统计基本信息;再从公共数据库下载已知的质粒序列数据,同源聚类并去冗余构建参考数据库;对确定为质粒的序列进行特征分析,全面刻画细菌质粒基因组的特征图谱;评估质粒所携带的抗菌素耐药基因的风险等级及相应的拷贝数数量,整体评估质粒耐药基因的风险程度;统计各细菌的质粒信息并进行归类统计,从整体上描述用户提供的细菌基因组的完整质粒信息。本发明方法可作为院内获得性感染,社区获得性感染,抗菌素耐药性流行和预测的基础工具,对于研究细菌内部因水平基因转移而增加的菌种遗传多样性及受体菌获得新的生物学性状方面也会有积极作用。
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公开(公告)号:CN113223618A
公开(公告)日:2021-08-06
申请号:CN202110579642.1
申请日:2021-05-26
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于宏基因组的临床重要致病菌毒力基因检测的方法和系统。该方法包括:S10,建立临床致病菌毒力基因数据库;S20,获取临床样本宏基因组测序原始数据,对其预处理获得目标数据;S30,利用预设宏基因组测序数据多重比对注释系统分析目标数据,鉴定毒力基因;S40,建立重要毒力基因‑毒力因子‑表征(功能/临床表型)关联数据库;S50,利用预设临床自动化报告系统,基于毒力基因鉴定结果和关联数据库,生成毒力基因鉴定报告。该系统能够对不同类型(脑脊液等)的临床感染样本的宏基因组测序数据进行毒力基因鉴定,一次性鉴定样本中多种病原菌的多个重要毒力基因,具有较好的灵敏性和准确性,帮助医生及时进行诊断、治疗和预后。
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公开(公告)号:CN221511965U
公开(公告)日:2024-08-13
申请号:CN202322625880.9
申请日:2023-09-26
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 首都医科大学附属北京胸科医院 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: A61B10/00
Abstract: 本实用新型属于医疗器械技术领域,公开了一种具有仿生结构的便携式舌拭子采样器。该装置包括采样组件,所述采样组件包括拭子杆以及套设于拭子杆外侧的套管,所述拭子杆一端设置有拭子头,且所述拭子头表面的绒毛为仿生老虎舌头表面倒刺的结构,所述套管外侧套设有收集组件。拭子杆一端设置有拭子头,且拭子头表面的绒毛为仿生老虎舌头表面倒刺的结构,拭子杆在伸出套管末端的第一限位环时,拭子头表面的绒毛在比拭子头直径小的第一限位环的作用下,使得其伸出时表面的绒毛均朝向手持方向,沿着患者的舌头由后向前进行刮取,朝向于手持方向的绒毛在刮取的过程中与刮取的方向相反,从而更加有效对舌头表面的分泌物等样品进行采集。
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