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公开(公告)号:CN115873962A
公开(公告)日:2023-03-31
申请号:CN202211628484.5
申请日:2022-12-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用SETX基因单核苷酸遗传标记鉴定虎斑云岭牛品种的方法。本发明利用全基因组关联分析方法,对云岭牛的全基因组SNP进行分析,发现了云岭牛的11号染色体上一个使SETX基因密码子改变的特有突变,为虎斑云岭牛实现品种鉴定提供了依据。同时根据该突变所在SNP位点可以在DNA水平上对云岭牛的虎斑毛色性状进行筛选,从而快速建立遗传资源优良的云岭牛种群。
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公开(公告)号:CN113789395B
公开(公告)日:2022-10-04
申请号:CN202111277432.3
申请日:2021-10-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种利用Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定瘤牛公牛来源的方法。本发明利用基因组重测序结果,对主要瘤牛群体的Y染色体DNA序列进行扫描,发现了东亚瘤牛、非洲瘤牛等瘤牛群体特有的Y染色体SNP位点,根据这些SNP位点可以在DNA水平上准确鉴别瘤牛公牛所属群体,能有效用于不同瘤牛群体的地方品种的引种及分子标记辅助育种,为快速建立遗传资源优良的瘤牛种群奠定基础。
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公开(公告)号:CN113789395A
公开(公告)日:2021-12-14
申请号:CN202111277432.3
申请日:2021-10-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种利用Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定瘤牛公牛来源的方法。本发明利用基因组重测序结果,对主要瘤牛群体的Y染色体DNA序列进行扫描,发现了东亚瘤牛、非洲瘤牛等瘤牛群体特有的Y染色体SNP位点,根据这些SNP位点可以在DNA水平上准确鉴别瘤牛公牛所属群体,能有效用于不同瘤牛群体的地方品种的引种及分子标记辅助育种,为快速建立遗传资源优良的瘤牛种群奠定基础。
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公开(公告)号:CN108841971B
公开(公告)日:2021-11-23
申请号:CN201810771166.1
申请日:2018-07-13
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686
Abstract: 本发明提供一种检测黄牛SH3PXD2B基因插入/缺失标记的方法:以待检黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2为引物,分别PCR扩增黄牛个体SH3PXD2B基因部分片段,通过电泳检测PCR扩增产物,根据电泳检测结果分别判定黄牛个体SH3PXD2B基因上两个插入/缺失突变位点的基因型;本发明根据检测到的SH3PXD2B基因indel突变位点NC_007318.6 g.4071212‑4071213 ins AGGAGTGGGTACC、g.4088290‑4088299 del TGTGGCCACA)的基因型,可应用于黄牛的分子标记辅助选择中,从而加快生长性状优良的地方黄牛种群的建立。
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公开(公告)号:CN108841969B
公开(公告)日:2021-11-23
申请号:CN201810770060.X
申请日:2018-07-13
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686
Abstract: 本发明提供一种检测黄牛MSRB3基因插入/缺失标记的方法:以待检黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2、P3和P4为引物,分别PCR扩增黄牛个体MSRB3基因部分片段,通过电泳检测PCR扩增产物,根据电泳检测结果分别判定黄牛个体MSRB3基因上四个插入/缺失突变位点的基因型;本发明根据检测到的MSRB3基因indel突变位点NC_007303.6g.48797975‑48798004del、g.48816764ins、g.48896074‑48896095del、g.48903091ins的基因型,可应用于黄牛的分子标记辅助选择中,从而加快生长性状优良的地方黄牛种群的建立。
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公开(公告)号:CN109161601B
公开(公告)日:2021-08-17
申请号:CN201811184564.X
申请日:2018-10-11
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种PLAGL1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用。以黄牛基因组DNA为模板,通过PCR扩增获得黄牛PLAGL1基因部分片段;将PCR产物经限制性内切酶Nde1消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛PLAGL1基因第95141位的SNP。本发明所检测的黄牛PLAGL1基因的SNP位点的基因型,可作为与牛生长性状密切相关的分子遗传标记,用于黄牛的分子标记辅助选择,推动良种牛繁育进程。
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公开(公告)号:CN109055578B
公开(公告)日:2021-08-17
申请号:CN201811185702.6
申请日:2018-10-11
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种PLAG1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用:以待测黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛PLAG1基因的部分片段;对扩增片段酶切后进行琼脂糖凝胶电泳,实现对黄牛PLAG1基因第48308位为C>T的碱基多态性位点的检测;关联分析确定TC和CC基因型与黄牛生长性状密切相关,可作为分子遗传标记用于黄牛分子标记辅助选择育种中,从而加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN109161601A
公开(公告)日:2019-01-08
申请号:CN201811184564.X
申请日:2018-10-11
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种PLAGL1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用。以黄牛基因组DNA为模板,通过PCR扩增获得黄牛PLAGL1基因部分片段;将PCR产物经限制性内切酶Nde1消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛PLAGL1基因第95141位的SNP。本发明所检测的黄牛PLAGL1基因的SNP位点的基因型,可作为与牛生长性状密切相关的分子遗传标记,用于黄牛的分子标记辅助选择,推动良种牛繁育进程。
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公开(公告)号:CN109055578A
公开(公告)日:2018-12-21
申请号:CN201811185702.6
申请日:2018-10-11
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172 , C12Q2531/113 , C12Q2521/301
Abstract: 本发明公开了一种PLAG1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用:以待测黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛PLAG1基因的部分片段;对扩增片段酶切后进行琼脂糖凝胶电泳,实现对黄牛PLAG1基因第48308位为C>T的碱基多态性位点的检测;关联分析确定TC和CC基因型与黄牛生长性状密切相关,可作为分子遗传标记用于黄牛分子标记辅助选择育种中,从而加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN107619857A
公开(公告)日:2018-01-23
申请号:CN201711003896.9
申请日:2017-10-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛KLF8基因CNV标记的方法及其应用:以肉牛品种郏县牛的血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增其KLF8基因CNV区域和内参基因BTF3,根据2*log2 2-ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型,鉴定其KLF8基因的拷贝数变异。与郏县牛生产数据的关联分析显示,KLF8不同拷贝数对郏县牛的生长发育有显著影响,其中缺失型个体的胸宽显著高于插入型和正常型个体。本发明在DNA水平上检测与肉牛生产性状密切相关的CNV,可作为肉牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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