一种GII.4型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法

    公开(公告)号:CN105039330A

    公开(公告)日:2015-11-11

    申请号:CN201510487540.1

    申请日:2015-08-10

    Abstract: 本发明公开了一种GII.4型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法。本发明分别以六对引物作为扩增引物的上下游引物,以GII.4型诺如病毒的RNA为模板进行RT-PCR扩增,分别得到扩增产物,然后对扩增产物进行核酸序列测序,然后再拼接比对,得到GII.4型诺如病毒基因组全长序列。本发明针对GII.4型诺如病毒主要流行基因型,根据基因组所包含的三个开放阅读框设计了“4+1+1”的分段扩增策略,并根据保守区域设计相应的扩增引物;其能有效的扩增出GII.4型诺如病毒的全基因组序列。本发明可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求及相应的科研领域。

    一种GII.17型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法

    公开(公告)号:CN105176984B

    公开(公告)日:2018-07-06

    申请号:CN201510617459.0

    申请日:2015-09-23

    Abstract: 本发明公开了一种GII.17型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法。本发明分别以七对引物作为扩增引物的上下游引物,以GII.17型诺如病毒的RNA为模板进行RT‑PCR扩增,分别得到扩增产物,然后对扩增产物进行核酸序列测序,然后再拼接比对,得到GII.17型诺如病毒基因组全长序列。本发明针对新出现的GII.17型诺如病毒流行基因型,根据基因组所包含的三个开放阅读框设计了“4+1+1”的分段扩增策略,根据保守区域设计相应的扩增引物,将该扩增引物应用于实际检出样本,获得了GII.17型诺如病毒基因组序列。本发明方法具有操作简单、周期短、成本低以及灵敏度高的特点,可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求及相应的科研领域。

    一种GII.P12/GII.3重组型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法

    公开(公告)号:CN105925573A

    公开(公告)日:2016-09-07

    申请号:CN201610510474.X

    申请日:2016-06-30

    CPC classification number: C12Q1/701 C12Q1/686 C12Q2531/113

    Abstract: 本发明公开了一种GII.P12/GII.3重组型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法。本发明分别以六对扩增引物作为扩增引物的上下游引物,以GII.P12/GII.3重组型诺如病毒的RNA为模板进行RT‑PCR扩增,分别得到扩增产物,然后采用以上六对扩增引物以及两条测序引物II.12‑Seq1R、II.3‑Seq6F对扩增产物进行核酸序列测序,然后再拼接比对,得到GII.P12/GII.3重组型诺如病毒基因组全长序列。本发明针对我国常见的一种GII.P12/GII.3重组型诺如病毒,根据其基因组所包含的三个开放阅读框设计了“4+1+1”的分段扩增策略,根据保守区域设计相应的扩增引物,将该扩增引物应用于实际检出样本,获得了GII.P12/GII.3重组型诺如病毒基因组序列。本发明可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等有诺如病毒检测需求及相关科研领域。

    一种从水体中高效浓缩病毒的方法

    公开(公告)号:CN104498445A

    公开(公告)日:2015-04-08

    申请号:CN201410790113.6

    申请日:2014-12-17

    Abstract: 本发明公开了一种从水体中高效浓缩病毒的方法。它是将待测水样去除杂质不溶物后,在其中加入足量的Mg2+和PO43+,以形成絮凝物沉淀待测水样中的病毒,然后再经负压抽滤过混合纤维滤膜,取下滤膜,用pH值3.5~4.5的溶液冲洗并溶解滤膜上的凝固物,得到洗涤液,洗涤液再经超滤浓缩,得到病毒浓缩液。本发明的方法除了能高浓缩效率的特点外,还有如下优点:一是快速:絮凝快,洗脱也快;二是比较简便:目前正电荷膜全部依靠进口,材料不易获得,应用本发明的方法,使用任何一种普通的微孔滤膜均可;三是可用于现场快速浓缩病毒:在现场采样时,不需要采取大量水样回到实验室进行检测,只需待水样絮凝静止沉降后,即可获得小体积的初步浓缩样品。

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