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公开(公告)号:CN115881213A
公开(公告)日:2023-03-31
申请号:CN202310065171.1
申请日:2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对哌拉西林‑他唑巴坦敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序;其被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法;按下述计算步骤计算:S1:按公式I计算k值:公式I:;S2:求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值;其中,C1‑C5分别为dfrA12、KPC‑1、determinant of bleomycin resistance、mphA、sul2基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对哌拉西林‑他唑巴坦敏感性的预测的准确率约98.3%。
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公开(公告)号:CN115466682B
公开(公告)日:2023-03-24
申请号:CN202211416787.0
申请日:2022-11-14
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 予果生物科技(北京)有限公司
IPC: C12N1/04
Abstract: 本发明属于微生物保存技术领域,涉及一种微生物保存液及其使用方法。本发明提供的微生物保存液,以质量份计,由以下有效成分构成:聚乙烯醇42‑75份、低密度脂蛋白2‑3份、四氢嘧啶6‑40份、硫乙醇酸钠0.5‑1.2份和甘油100份。本发明提供的微生物保存液为微生物保存提供载体,能有效保护微生物活性,提高菌体存活率和菌体活性。
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公开(公告)号:CN114807403A
公开(公告)日:2022-07-29
申请号:CN202210725237.0
申请日:2022-06-24
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 领航基因科技(杭州)有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本公开涉及一种用于检测普罗威登斯菌的核酸试剂和数字PCR试剂盒,该核酸试剂包括SEQ ID NO.1‑6所示的引物和SEQ ID NO.9‑11所示的探针。本公开建立了同时检测斯氏普罗威登斯菌、产碱普罗威登斯菌和雷氏普罗威登斯菌的检测体系;检测体系中含有外源内控作为对照,能够对检测过程进行质控;检测结果具有良好的灵敏度和特异性。
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公开(公告)号:CN115881213B
公开(公告)日:2023-06-02
申请号:CN202310065171.1
申请日:2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对哌拉西林‑他唑巴坦敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序;其被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法;按下述计算步骤计算:S1:按公式I计算k值:公式I:;S2:求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值;其中,C1‑C5分别为dfrA12、KPC‑1、determinant of bleomycin resistance、mphA、sul2基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对哌拉西林‑他唑巴坦敏感性的预测的准确率约98.3%。
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公开(公告)号:CN115798575B
公开(公告)日:2023-06-02
申请号:CN202310065212.7
申请日:2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对头孢他啶敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括:计算单元;计算单元包括:计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序;所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法;所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算:S1:按下述公式I计算k值:公式I:;S2:求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值;其中,C1‑C5分别为KPC‑1、sul1、CTX‑M‑55、CTX‑M‑15、TEM‑1基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对头孢他啶敏感性的预测的准确率约90.6%。
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公开(公告)号:CN115938478A
公开(公告)日:2023-04-07
申请号:CN202310065146.3
申请日:2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对阿米卡星敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括:计算单元;计算单元包括:计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序;所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法;所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算:S1:按下述公式I计算k值:公式I:;S2:求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值;C1‑C5分别为arr‑2、acrB、armA、oqxB、rmtB基因在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对阿米卡星敏感性的预测的准确率约98.8%。
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公开(公告)号:CN115862730A
公开(公告)日:2023-03-28
申请号:CN202310065401.4
申请日:2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对头孢西丁敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序;所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法;所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算:S1:按下述公式I计算k值:公式I:;S2:求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值;其中,C1‑C5分别为ramA、sul1、KPC‑1、DHA‑1、bleomycin resistance determinant基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对头孢西丁敏感性的预测的准确率约94.7%。
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公开(公告)号:CN115798577A
公开(公告)日:2023-03-14
申请号:CN202310065354.3
申请日:2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对左氧氟沙星敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序;所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法;所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算:S1:按下述公式I计算k值:公式I:;S2:求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值;其中,C1‑C5分别为TEM‑1、OmpA、AAC(6')‑Ib‑cr6、KPC‑1、QnrS1基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对左氧氟沙星敏感性的预测的准确率约89.5%。
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公开(公告)号:CN115798576A
公开(公告)日:2023-03-14
申请号:CN202310065262.5
申请日:2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对亚胺培南敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序;所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法;所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算:S1:按下述公式I计算k值:公式I:;S2:求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值;其中,C1‑C5分别为bleomycin resistance determinant、ramA、mphA、KPC‑1、catI基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对亚胺培南敏感性的预测的准确率约99.4%。
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公开(公告)号:CN115798575A
公开(公告)日:2023-03-14
申请号:CN202310065212.7
申请日:2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对头孢他啶敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括:计算单元;计算单元包括:计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序;所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法;所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算:S1:按下述公式I计算k值:公式I:;S2:求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值;其中,C1‑C5分别为KPC‑1、sul1、CTX‑M‑55、CTX‑M‑15、TEM‑1基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对头孢他啶敏感性的预测的准确率约90.6%。
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