一种大豆基因拷贝数变异分析方法

    公开(公告)号:CN106755444A

    公开(公告)日:2017-05-31

    申请号:CN201611266452.X

    申请日:2016-12-31

    CPC classification number: C12Q1/6851 C12Q2531/113 C12Q2537/16 C12Q2545/101

    Abstract: 本发明提供一种大豆基因拷贝数变异分析方法,包括以下步骤:1)基因组DNA的提取和浓度均一化;2)被测基因引物设计;3)以β‑actin为内参基因,用内参基因引物与步骤2)涉及的被测基因引物分别对基因组DNA模板进行荧光定量PCR反应;4)利用RT‑qPCR获得被测基因和内参基因β‑actin的Ct值计算被测基因在不同大豆品种中的相对丰度值,通过被测基因在不同大豆品种中的相对丰度值之间的比值判断被测基因在不同品种大豆中的拷贝数变异关系。本方法基因组DNA用量较高通量测序、微阵列法和原位杂交技术用量少103倍;无需进行测序和杂交探针合成,成本低廉、操作简单、可实现大样本分析。

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