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公开(公告)号:CN107988385A
公开(公告)日:2018-05-04
申请号:CN201711262485.1
申请日:2017-12-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛PLAG1基因Indel标记的方法及其专用试剂盒:基于PCR技术,以肉牛(郏县红牛)的血液基因组DNA池为模板,利用特异引物对P1扩增牛PLAG1基因的Indel位点,然后进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果将不同个体分为缺失型、正常型以及杂合型,本发明提供的方法建立在肉牛PLAG1基因Indel位点与生长性状之间的关联性基础上,方法不仅简单,快速,便于推广应用,而且有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作。
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公开(公告)号:CN107513579A
公开(公告)日:2017-12-26
申请号:CN201710985234.X
申请日:2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛CRABP2基因单核苷酸多态性的方法及其专用试剂盒。以黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,PCR扩增黄牛CRABP2基因;PCR产物分别经限制性内切酶Apa I和Sal I消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛CRABP2基因第2458位和3878位的单核苷酸多态性。本发明所述的方法能够检测黄牛CRABP2基因的单核苷酸多态性,在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切的相关分子遗传标记,从而用于牛的辅助选择和分子育种,加快本地黄牛良种繁育速度。
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公开(公告)号:CN115873962B
公开(公告)日:2024-09-20
申请号:CN202211628484.5
申请日:2022-12-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用SETX基因单核苷酸遗传标记鉴定虎斑云岭牛品种的方法。本发明利用全基因组关联分析方法,对云岭牛的全基因组SNP进行分析,发现了云岭牛的11号染色体上一个使SETX基因密码子改变的特有突变,为虎斑云岭牛实现品种鉴定提供了依据。同时根据该突变所在SNP位点可以在DNA水平上对云岭牛的虎斑毛色性状进行筛选,从而快速建立遗传资源优良的云岭牛种群。
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公开(公告)号:CN107988385B
公开(公告)日:2020-09-29
申请号:CN201711262485.1
申请日:2017-12-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛PLAG1基因Indel标记的方法及其专用试剂盒:基于PCR技术,以肉牛(郏县红牛)的血液基因组DNA池为模板,利用特异引物对P1扩增牛PLAG1基因的Indel位点,然后进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果将不同个体分为缺失型、正常型以及杂合型,本发明提供的方法建立在肉牛PLAG1基因Indel位点与生长性状之间的关联性基础上,方法不仅简单,快速,便于推广应用,而且有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作。
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公开(公告)号:CN107475400B
公开(公告)日:2020-03-06
申请号:CN201710802522.7
申请日:2017-09-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/683
Abstract: 本发明公开了一种MYLK4基因辅助检测牛生长性状的方法及其专用试剂盒。以黄牛基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增获得黄牛MYLK4基因;PCR产物经限制性内切酶HhaI消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛MYLK4基因第61595位的单核苷酸多态性。本发明所阐述的方法能够检测黄牛MYLK4基因的单核苷酸多态性,可作为与牛生长性状密切相关分子遗传标记,用于牛的辅助选择和分子育种,加快良种牛繁育速度。
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公开(公告)号:CN106636429B
公开(公告)日:2019-12-13
申请号:CN201710051013.5
申请日:2017-01-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/686 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ADNCR基因单核苷酸多态性的四引物扩增受阻突变体系PCR检测方法及其应用。以待测黄牛全基因组DNA为模板,通过四引物扩增受阻突变体系PCR扩增长链非编码RNA ADNCR基因片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定长链非编码RNA ADNCR基因在g.1263T>A位点存在不同的基因型。结果发现,长链非编码RNA ADNCR基因g.1263T>A的单核苷酸不同类型与秦川牛的坐骨端宽性状之间存在显著相关,提示长链非编码RNA ADNCR基因单核苷酸多态不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记,有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN107119117B
公开(公告)日:2019-10-29
申请号:CN201710284523.7
申请日:2017-04-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以秦川牛的血液全基因组DNA为模板,利用两对特异引物GBP2‑CNV1和GBP2‑CNV2分别扩增牛GBP2基因的两个拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增秦川牛BTF3基因作为对照,然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在秦川牛GBP2基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN108841969A
公开(公告)日:2018-11-20
申请号:CN201810770060.X
申请日:2018-07-13
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686
Abstract: 本发明提供一种检测黄牛MSRB3基因插入/缺失标记的方法:以待检黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2、P3和P4为引物,分别PCR扩增黄牛个体MSRB3基因部分片段,通过电泳检测PCR扩增产物,根据电泳检测结果分别判定黄牛个体MSRB3基因上四个插入/缺失突变位点的基因型;本发明根据检测到的MSRB3基因indel突变位点NC_007303.6g.48797975-48798004del、g.48816764ins、g.48896073-48896094del、g.48903091ins的基因型,可应用于黄牛的分子标记辅助选择中,从而加快生长性状优良的地方黄牛种群的建立。
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公开(公告)号:CN106947826A
公开(公告)日:2017-07-14
申请号:CN201710289845.0
申请日:2017-04-27
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法及其应用,以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,PCR扩增黄牛SERPINA3基因部分片段;利用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物片段大小;用限制性内切酶BstXI酶切PCR扩增片段之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SERPINA3基因第648位的单核苷酸多态性位点的基因型;本发明提供的检测方法可用于夏南牛等中国地方黄牛品种肉用生长性状的分子标记辅助选择,进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN117512120A
公开(公告)日:2024-02-06
申请号:CN202310052622.8
申请日:2023-02-02
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6874 , C12Q1/6806 , C40B50/06 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于靶向捕获测序的驴40K液相芯片及其应用。驴40K液相芯片由独立包装的探针混合液和杂交捕获试剂构成,所述探针混合液包括根据筛选的45894个SNP位点设计并合成的捕获探针,通过灵活调整使所述驴40K液相芯片密度可以减少至低密度1K,也可以扩展至高密度200K。解决了由于标记密度不均匀和多态性较差所导致的驴高通量SNP芯片匮乏的问题,为驴的标记辅助选育研究和应用提供了高效的基因组分型途径。
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