公开(公告)号：CN116863998A

公开(公告)日：2023-10-10

申请号：CN202310741264.1

申请日：2023-06-21

Applicant: 扬州大学

Inventor： 徐扬 ,  张宇翔 ,  周恺 ,  于广宁 ,  李成 ,  杨文艳 ,  王欣 ,  徐辰武 ,  杨泽峰 ,  鲁月 ,  陈茹佳 ,  陶天云 ,  李鹏程

IPC: G16B20/50 ,  G16B15/00 ,  G16B5/00 ,  G16B40/00 ,  G06N3/126

Abstract: 本发明属于生物信息领域，涉及一种基于遗传算法的全基因组预测方法及其应用，采用基因组最佳线性无偏估计模型来预测个体的育种值，包括以下步骤：获取待预测作物的分子标记；从中重复地随机选择一定比例的分子标记子集供遗传算法初始化，并构建基因组预测模型，计算不同分子标记子集的适合度，保留适合度较高的分子标记子集，将保留的分子标记子集以一定的比率进行突变、配对、交叉互换，产生新的分子标记子集；再次计算不同分子标记子集的适合度函数，保留适合度较高的分子标记子集，直到达到最大迭代次数或者收敛，得到最终的分子标记子集并构建基因组最佳线性无偏估计模型用于全基因组预测。本发明方法可用于提高杂交种全基因组选择的准确性，可以为杂交种的精准选育提供重要的技术支撑。

公开(公告)号：CN116731142A

公开(公告)日：2023-09-12

申请号：CN202310909406.0

申请日：2023-07-24

Applicant: 扬州大学

Inventor： 李鹏程 ,  杨爱清 ,  李琦 ,  王后苗 ,  王芸芸 ,  杨泽峰 ,  徐辰武

IPC: C07K14/415 ,  C12N15/82 ,  C12N15/29 ,  A01H6/46 ,  A01H5/06

Abstract: 本发明涉及植物基因工程领域，具体涉及一种ZmSAUR21基因、蛋白及其在调控苗期玉米根系发育的应用。在玉米中定点突变所述ZmSAUR21基因，主胚根轴根长、种子根轴根平均长度等性状均显著降低；在玉米中过表达所述ZmSAUR21基因，主胚根轴根长、种子根轴根平均长度等性状均显著升高。因此，本发明为调控玉米苗期根系发育提供了宝贵的基因资源。

公开(公告)号：CN116574840A

公开(公告)日：2023-08-11

申请号：CN202310758749.1

申请日：2023-06-26

Applicant: 扬州大学

Inventor： 徐扬 ,  于广宁 ,  周恺 ,  张宇翔 ,  李成 ,  杨文艳 ,  徐一亿 ,  李芙蓉 ,  关秀生 ,  陈茹佳 ,  鲁月 ,  李鹏程 ,  杨泽峰 ,  徐辰武

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种玉米耐旱基因位点的开发方法及应用，属于基因组序列及植物生物技术领域。它包括检测待测玉米的基因型，根据基因型结果鉴定或辅助鉴定耐旱；ZmReDroSNP0201492位点是玉米基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为A或T，为序列表中SEQ ID No.1的第71位核苷酸；ZmReDroSNP1038761位点是玉米基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或C，为序列表中SEQ ID No.2的第71位核苷酸。本发明开发了新的玉米耐旱基因位点，并利用KASP分型技术对耐旱基因位点进行快速基因分型，可用于玉米分子标记辅助育种。分子标记辅助玉米进行耐旱性选育，选择效率高、周期短，可在苗期进行定向基因型选择，淘汰大量不耐旱的材料，降低育种成本，提高育种效率。

公开(公告)号：CN116253781A

公开(公告)日：2023-06-13

申请号：CN202211074755.7

申请日：2022-09-02

Applicant: 扬州大学

Inventor： 陈茹佳 ,  杨泽峰 ,  黄千凤 ,  徐扬 ,  徐辰武 ,  鲁月 ,  陶天云 ,  李鹏程

IPC: C07K14/415 ,  C12N15/29 ,  C12N15/84 ,  A01H5/04 ,  A01H5/10 ,  A01H5/00 ,  A01H6/46 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明属于植物基因工程领域，涉及水稻OsDNE1蛋白及其编码基因和应用。本发明所述蛋白及其编码基因可提高植株株高、提高分蘖数量、提高种子数量、增大种子长度和/或提高产量。本发明所述蛋白及其编码基因可用于增加水稻产量和改良水稻外观品质，在水稻育种上具有重要意义，可以为提高水稻产量和改良粒型提供重要的生物资源。

公开(公告)号：CN119824134A

公开(公告)日：2025-04-15

申请号：CN202510257581.5

申请日：2025-03-05

Applicant: 扬州大学

Inventor： 王后苗 ,  田一嵋 ,  朱天泽 ,  李鹏程 ,  王芸芸 ,  徐辰武

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种与玉米耐旱性和侧根长相关的PARMS分子标记及其应用，所述分子标记上下游各150bp的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。检测该PARMS分子标记的引物组核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.3所示。本发明成功开发了一种基于玉米ZmbZIP89(Zm00001eb238570)基因3'UTR区域自然变异的分子标记，该标记与玉米侧根长度和耐旱性状显著相关，能够准确、高效、稳定地区分InDel+基因型和InDel‑基因型。该分子标记可广泛应用于玉米耐旱种质资源的高通量筛选和分子标记辅助育种，为培育高产、稳产、耐旱的玉米新品种提供重要的技术支撑和理论依据。

公开(公告)号：CN119082190A

公开(公告)日：2024-12-06

申请号：CN202411456912.X

申请日：2024-10-18

Applicant: 扬州大学

Inventor： 李鹏程 ,  闫宇星 ,  王后苗 ,  王芸芸 ,  杨泽峰 ,  徐辰武

IPC: C12N15/82 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11 ,  A01H1/04 ,  C12N15/60 ,  A01H5/06 ,  A01H6/46 ,  C12N9/98

Abstract: 本发明涉及分子标记及其应用，具体涉及ZmGAD基因、InDel分子标记在调控玉米根系GABA含量中的应用。本发明所提供的分子标记ZmGAD‑INDEL10842具有扩增稳定、检测效率高等特点，为玉米根系GABA含量的分子标记辅助育种提供了有效标记资源，可促进玉米抗逆能力的遗传改良，助力玉米高产新品种培育。

公开(公告)号：CN116218887A

公开(公告)日：2023-06-06

申请号：CN202310026378.8

申请日：2023-01-09

Applicant: 扬州大学

Inventor： 鲁月 ,  杨泽峰 ,  肖宁 ,  李爱宏 ,  陈茹佳 ,  陶天云 ,  蔡跃 ,  方慧敏 ,  徐辰武 ,  徐扬 ,  李鹏程

IPC: C12N15/57 ,  C12N15/82 ,  A01H5/00 ,  A01H6/46 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明属于植物基因工程领域，具体涉及一种水稻酰胺酶蛋白基因OsAMID及其在提高产量方面的应用。本发明通过全基因组关联分析的正向遗传学方法定位到一个显著影响水稻穗粒数的位点，并鉴定到其中的候选基因OsAMID。进一步通过分子生物学实验验证了OsAMID的功能，并发掘了其优异等位基因OsAMID‑HET。OsAMID‑HET能够显著提升水稻的穗粒数和单株产量。本发明可以为提高水稻的穗粒数和产量提供重要的基因资源，对于水稻高产育种有潜在的应用价值。

公开(公告)号：CN114196685A

公开(公告)日：2022-03-18

申请号：CN202111575000.0

申请日：2021-12-21

Applicant: 扬州大学

Inventor： 李鹏程 ,  武婷婷 ,  王后苗 ,  吉伟东 ,  汤潇 ,  徐暑晖 ,  杨泽峰 ,  徐辰武

IPC: C12N15/53 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  G16B20/00

Abstract: 本发明公开了一种玉米茎秆穿刺强度基因ZmFLS2及其分子标记的应用，属于分子生物领域，该玉米ZmFLS2基因具有调控玉米茎秆穿刺强度的作用，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，位于S5_210155797上游91bp处，其SNP分子标记位于玉米ZmFLS2基因的‑397bp处，该处碱基为G或A。本发明通过全基因组关联分析(GWAS)技术方法，在玉米基因组中筛选到与茎秆穿刺强度性状相关基因ZmFLS2，该基因对调控玉米茎秆强度起到非常关键的作用，这一发现可能有助于阐明茎秆强度的遗传基础；此外，已鉴定的候选基因和变异具有潜在的育种价值，可用于分子标记辅助选择育种改良玉米抗倒性。

公开(公告)号：CN119061022A

公开(公告)日：2024-12-03

申请号：CN202411135460.5

申请日：2024-08-19

Applicant: 扬州大学

Inventor： 李鹏程 ,  朱天泽 ,  王后苗 ,  王芸芸 ,  徐辰武 ,  杨泽峰

IPC: C12N15/29 ,  C07K14/415 ,  C12N15/82 ,  C12N15/84 ,  A01H5/00 ,  A01H5/06 ,  A01H6/46

Abstract: 本发明涉及植物基因工程领域，具体涉及ZmbZIP89基因在调控玉米侧根发育和耐旱性中的应用。在玉米中过表达ZmbZIP89基因，侧根长、平均侧根长、侧根密度、总根长、根系生物量、侧根原基密度均显著增加。在ZmbZIP89超表达材料干旱表型实验中，超表达ZmbZIP89基因后干旱胁迫之后的存活率显著高于野生型，并且超表达植株的侧根长显著高于野生型。综上，ZmbZIP89通过影响侧根发育，从而调控玉米水分吸收，使植株更耐旱，有望作为改良玉米根系和耐旱性的目标基因。

公开(公告)号：CN116949059A

公开(公告)日：2023-10-27

申请号：CN202310928714.8

申请日：2023-07-27

Applicant: 扬州大学

Inventor： 李鹏程 ,  段娅敏 ,  汤潇 ,  王后苗 ,  王芸芸 ,  杨泽峰 ,  徐辰武

IPC: C12N15/29 ,  C07K14/415 ,  C12N15/82 ,  A01H5/06 ,  A01H6/46 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明涉及植物基因工程领域，具体涉及ZmCASP4基因在调控根系发育和矿质元素吸收中的应用，在玉米中过表达ZmCASP4基因，主胚根总根长、主胚根侧根长、种子根总根长、种子根侧根长、总根长和侧根长显著高于野生型B104；超表达ZmCASP4基因后N和Ca在地上部的积累显著小于野生型；在玉米中定点突变所述ZmCASP4基因，主胚根总根长、主胚根侧根长、种子根总根长、种子根侧根长、总根长和侧根长显著低于野生型；敲除ZmCASP4基因后N和Ca在地上部的积累显著大于野生型。因此，本发明为改良根系构型和矿质元素吸收提供了宝贵的基因资源，对培育高产、抗逆的玉米新品种具有十分重要深远的意义。