公开(公告)号：CN118184796A

公开(公告)日：2024-06-14

申请号：CN202410216797.2

申请日：2024-02-27

Applicant: 厦门大学

Inventor： 张永有 ,  王新栋 ,  邓旭晟 ,  邱露 ,  杜浩然

IPC: C07K19/00 ,  C12Q1/6869 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明公开了一种蛋白质‑DNA互作系统及其应用，包括敲入位于细胞内的目标蛋白因子的N端或C端的一配体和一融合蛋白，该配体包括敲入位于细胞内的目标蛋白因子的N端或C端的一短肽、修饰于药物上的生物素或内源性DNA G4结构，该融合蛋白包括从N端到C端依次相连的功能亚基和突变转座酶Tn5。本发明解决了传统抗体依赖的转录调控机制探究技术存在的问题，对不同的转录因子、药物或DNA G4结构都可以得到均一稳定的测序数据，提高数据质量，一步特异性结合可显著降低背景强度，提升目标基因的富集丰度，相较于抗体依赖的蛋白质‑DNA互作体系具有特殊优势。利用本发明进行目标蛋白因子、药物或DNA G4结构所结合的DNA序列进行建库测序的操作流程简单便捷，时间明显缩短。

公开(公告)号：CN117683765A

公开(公告)日：2024-03-12

申请号：CN202311706163.7

申请日：2023-12-13

Applicant: 厦门大学

Inventor： 张永有 ,  刘本超

IPC: C12N15/10 ,  C12N9/22

Abstract: 本发明公开了一种DNA片段组装方法，包括如下步骤：(1)设计至少一插入片段扩增引物对，通过PCR扩增在至少一插入片段的两端分别引入至少一核糖核苷酸，且当插入片段的数目多于一时，相邻插入片段间具有同源臂；(2)获得能够与步骤(1)所得的至少一插入片段的PCR扩增产物相连的载体片段的PCR扩增产物或酶切产物；(3)将步骤(1)获得的至少一插入片段的PCR扩增产物和步骤(2)所得的载体片段的PCR扩增产物用RNase H进行处理；或将步骤(1)获得的至少一插入片段的PCR扩增产物用RNase H进行处理，与步骤(2)所得的载体片段的酶切产物混合；(4)将步骤(3)所得的产物进行体内或体外组装。本发明组装阳性率高，可以获得高于90％阳性克隆，可应用于体内体外的多DNA片段的组装、DNA多位点的定点突变和小片段的组装。

公开(公告)号：CN112608996B

公开(公告)日：2022-05-10

申请号：CN202110048363.2

申请日：2021-01-14

Applicant: 厦门大学

Inventor： 张永有 ,  胡会龙

IPC: C12Q1/6883 ,  C12Q1/6851

Abstract: 本发明公开了一种基于ddPCR的CD45基因分型检测、小鼠骨髓重建能力检测方法及应用。提取小鼠的基因组DNA，利用荧光标记的CD45.1、CD45.2检测探针，通过ddPCR技术对CD45.1和CD45.2抗原进行定量，从而检测小鼠骨髓重建能力；上游序列为SED ID No.1，下游序列为SED ID No.2，CD45.1检测探针的序列为SED ID No.3,CD45.2检测探针的序列为SED ID No.4。本方法只需要少量的血液样本，无需购买昂贵的抗体即可对CD45.1和CD45.2抗原进行定量，从而量化基因修饰细胞和非基因修饰细胞，并据此评估基因修饰对小鼠骨髓重建能力的影响。

公开(公告)号：CN112608996A

公开(公告)日：2021-04-06

申请号：CN202110048363.2

申请日：2021-01-14

Applicant: 厦门大学

Inventor： 张永有 ,  胡会龙

IPC: C12Q1/6883 ,  C12Q1/6851

Abstract: 本发明公开了一种基于ddPCR的CD45基因分型检测、小鼠骨髓重建能力检测方法及应用。提取小鼠的基因组DNA，利用荧光标记的CD45.1、CD45.2检测探针，通过ddPCR技术对CD45.1和CD45.2抗原进行定量，从而检测小鼠骨髓重建能力；上游序列为SED ID No.1，下游序列为SED ID No.2，CD45.1检测探针的序列为SED ID No.3,CD45.2检测探针的序列为SED ID No.4。本方法只需要少量的血液样本，无需购买昂贵的抗体即可对CD45.1和CD45.2抗原进行定量，从而量化基因修饰细胞和非基因修饰细胞，并据此评估基因修饰对小鼠骨髓重建能力的影响。

公开(公告)号：CN114627966A

公开(公告)日：2022-06-14

申请号：CN202011450416.5

申请日：2020-12-11

Applicant: 厦门大学

Inventor： 张永有 ,  马绍骞

IPC: G16B30/10 ,  G16B20/20 ,  G16B20/50 ,  G16B25/20 ,  G16B50/30 ,  C12Q1/70 ,  C12Q1/6858 ,  C12R1/93

Abstract: 本申请涉及一种评估用于检测病原体的试剂的有效性的方法，以及一种评估用于检测病原体的试剂或试剂的组合的有效性的装置。本申请的方法和装置可以对新设计的基于核酸序列的病原体(特别是病毒)检测试剂(例如引物和探针)的有效性、覆盖度等进行评估，辅助诊断试剂的开发。