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公开(公告)号:CN119296648A
公开(公告)日:2025-01-10
申请号:CN202411173103.8
申请日:2024-08-26
Applicant: 华中科技大学同济医学院附属同济医院
IPC: G16B30/10 , G16B40/00 , G06F18/2135 , G06F18/22 , G06F18/27
Abstract: 本发明公开了一种基于二代测序技术检测KMT2A基因部分串联重复的方法和系统,该方法包括以下步骤:S1:待测样本经NGS实验流程测序完成后得到fastq格式的测序数据,对测序数据进行QC和比对,得到bam格式的比对数据;S2:对数据进行深度计算,使用loess回归对深度进行GC校正,使用PCA方法以预先建立的正常样本基线去除待测样本中的噪音得到最终log‑ratio;S3:使用CBS方法对log‑ratio分段;S4:使用基于MCMC的吉布斯采样对数据进行拟合,计算出KMT2A基因是否存在PTD突变。本发明方法检测灵敏度高,能够在一次panel数据中检测KMT2A‑PTD,联合高通量测序的优势,全方面地评估待测样本诊疗相关基因的变异状态。
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公开(公告)号:CN118091137B
公开(公告)日:2024-11-05
申请号:CN202311716423.9
申请日:2023-12-14
Applicant: 华中科技大学同济医学院附属同济医院
IPC: G01N33/574 , G01N33/533 , C07K16/28
Abstract: 本申请涉及抗体检测技术领域,尤其涉及一组用于检测微量组织样本筛查血液肿瘤的抗体组合物及其应用;所述抗体组合物包括抗CD5抗体、抗CD19抗体、抗CD45抗体、抗CD4抗体、抗kappa抗体、抗CD56抗体、抗Lambda抗体、抗7‑AAD抗体、抗CD7抗体、抗CD3抗体、抗CD138抗体、抗CD38抗体、抗CD20抗体和抗CD8抗体;该抗体组合物可以一管法筛查B、T、NK及浆细胞肿瘤,应用于量少的组织样本初筛,一管初筛可以节省样本,而留一管样本进行加做,同时加入抗7‑AAD抗体,可排除组织样本中坏死细胞干扰,从而提高诊断的敏感性和特异性。
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公开(公告)号:CN116790812A
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202310574152.1
申请日:2023-05-19
Applicant: 华中科技大学同济医学院附属同济医院
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本申请涉及生物技术领域,尤其涉及一种检测EB病毒核酸拷贝数的试剂盒及其应用;所述试剂盒包括EBV引物对,所述EBV引物对包括如SEQ ID NO.1所示的EBV正向引物和如SEQ ID NO.2所示的EBV反向引物;由于微滴数字PCR不需要扩增DNA,因此其检测的数据为DNA的绝对定量数值,相比RT‑PCT具有更高的精度与准确度,而通过针对微滴数字PCR设计针对EBV的引物对,可以对含有EBV的微滴进行扩增,得到足够有效液滴数,从而能通过后续微滴分析过程中有效的剔除掉不符合预期的微滴,进而能提试剂盒检测的准确性,能通过试剂盒的阳性判断值直接判断样本的性质,从而可以对样本进行绝对定量检测。
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