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公开(公告)号：CN115732032A
公开(公告)日：2023-03-03
申请号：CN202111000286.X
申请日：2021-08-27
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: G16B20/30
Abstract: 本申请涉及生物信息学领域，具体涉及一种测序数据分析方法和系统，该方法基于“隐藏亚组理论”对测序过程中的组分进行分析。本申请方法不依赖于任何待测信号的先验知识，即可进行有效的生信分析。
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公开(公告)号：CN115725707A
公开(公告)日：2023-03-03
申请号：CN202111000367.X
申请日：2021-08-27
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本申请涉及一种测序数据绝对定量的生信分析方法和系统。本方法基于阴性对照与阳性对照之间形成的隐藏亚组，以及待测样本与阴性对照之间形成的隐藏亚组，对待测样本进行绝对定量。本申请不依赖于任何对待测真实信号的先验知识，即可准确定量待测样本。
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公开(公告)号：CN113223618B
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202110579642.1
申请日：2021-05-26
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于宏基因组的临床重要致病菌毒力基因检测的方法和系统。该方法包括：S10，建立临床致病菌毒力基因数据库；S20，获取临床样本宏基因组测序原始数据，对其预处理获得目标数据；S30，利用预设宏基因组测序数据多重比对注释系统分析目标数据，鉴定毒力基因；S40，建立重要毒力基因‑毒力因子‑表征(功能/临床表型)关联数据库；S50，利用预设临床自动化报告系统，基于毒力基因鉴定结果和关联数据库，生成毒力基因鉴定报告。该系统能够对不同类型(脑脊液等)的临床感染样本的宏基因组测序数据进行毒力基因鉴定，一次性鉴定样本中多种病原菌的多个重要毒力基因，具有较好的灵敏性和准确性，帮助医生及时进行诊断、治疗和预后。
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公开(公告)号：CN114561380A
公开(公告)日：2022-05-31
申请号：CN202210351969.8
申请日：2022-04-02
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
Abstract: 本发明提供了一种用于细菌核酸提取检测试剂、试剂盒及其方法和应用，所述提取检测试剂含有InstaGeneMatrix、SDS、KCl、EDTA和Sarkosyl，本发明能够实现快速高效提取大肠杆菌核酸DNA，将大肠杆菌的提取检测限提高到100拷贝数/ml；从复杂样本中亦能快速高效提取到大肠杆菌核酸，验证了本提取方法潜在的临床适用性。
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公开(公告)号：CN114464253A
公开(公告)日：2022-05-10
申请号：CN202210203436.5
申请日：2022-03-03
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: G16B20/20 , G16B20/30 , C12Q1/6869 , C12Q1/689 , C12Q1/70
Abstract: 本发明提供了一种基于长读长测序进行实时病原检测的方法、系统和应用，包括(1)测序下机数据监测及定时分析启动；(2)获取测序fastq数据，并对数据进行质控；(3)质控后的数据与人的参考基因组比对，并去除比对上的reads；(4)去除人源reads的数据与微生物数据库进行比对和统计，检测报出测序数据中的病原微生物种类；(5)到达设定间隔时间后，新产生的数据顺序执行步骤(2)至(3)，并与前一个时间间隔步骤(3)产生的数据合并，执行步骤(4)。本发明能够应用长读长测序数据实时、快速、准确完成临床样本病原微生物检测，具有重要的应用价值。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114350769A
公开(公告)日：2022-04-15
申请号：CN202111482943.9
申请日：2021-12-07
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: C12Q1/6869 , G16B30/10 , G16B40/10
Abstract: 本发明提供了一种基于Nanopore测序技术特征化细菌DNA甲基化的方法和应用，属于生物信息技术领域，包括如下步骤：获取目标菌株的Nanopore测序fast5和fastq数据，对测序数据进行质控；获取目标菌株参考基因组，利用nanopolish或tombo软件获得不同修饰类型位点的全基因组范围的DNA甲基化水平；特征化细菌的DNA甲基化模式，深入阐述基于DNA甲基化的表观遗传的调控机制。本发明提供的方法可以帮助全面特征化细菌的DNA甲基化图谱，探索之前隐藏的细菌领域的表观遗传调控机制，具有重要的应用价值。
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公开(公告)号：CN118748039A
公开(公告)日：2024-10-08
申请号：CN202410918254.5
申请日：2024-07-10
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司
Abstract: 本发明属于分子生物学技术领域，公开了一种评估通用引物物种/分型水平鉴定能力的方法。包括：构建微生物数据库，将通用引物比对到微生物数据库中获得靶向片段以及通用引物对应的物种/分型信息，将靶向片段从F端截取特定长度得到测序数据，去重、统计后，将测序数据比对到微生物数据库进行物种分类鉴定，计算通用引物对于特定物种/分型的序列回比率，评估通用引物针对特定物种/分型水平的鉴定能力。本发明为病原微生物鉴定提供一种评价通用引物物种水平鉴定能力的方法，评估通用引物鉴定物种/分型的性能。
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公开(公告)号：CN114464253B
公开(公告)日：2023-03-10
申请号：CN202210203436.5
申请日：2022-03-03
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: G16B20/20 , G16B20/30 , C12Q1/6869 , C12Q1/689 , C12Q1/70
Abstract: 本发明提供了一种基于长读长测序进行实时病原检测的方法、系统和应用，包括(1)测序下机数据监测及定时分析启动；(2)获取测序fastq数据，并对数据进行质控；(3)质控后的数据与人的参考基因组比对，并去除比对上的reads；(4)去除人源reads的数据与微生物数据库进行比对和统计，检测报出测序数据中的病原微生物种类；(5)到达设定间隔时间后，新产生的数据顺序执行步骤(2)至(3)，并与前一个时间间隔步骤(3)产生的数据合并，执行步骤(4)。本发明能够应用长读长测序数据实时、快速、准确完成临床样本病原微生物检测，具有重要的应用价值。
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公开(公告)号：CN115719614A
公开(公告)日：2023-02-28
申请号：CN202111000370.1
申请日：2021-08-27
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: G16B20/30
Abstract: 本申请涉及一种测序数据背景噪音剔除的生信分析方法和系统。本方法基于“引入的噪音信号会形成隐藏亚组”，对样本中组分之间的连接进行分析，从而实现在最大程度保留真实信号前提下，更加有效剔除引入的噪音信号。本申请不依赖于任何对待测真实信号和噪音信号的先验知识，即可高效去除噪音。
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公开(公告)号：CN114591945B
公开(公告)日：2022-12-06
申请号：CN202210351200.6
申请日：2022-04-02
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 西咸新区予果微码生物科技有限公司 , 予果智造科技(北京)有限公司
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6806 , C12Q1/70 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种DNA病毒核酸提取检测试剂、试剂盒及其方法和应用，所述提取检测试剂由InstaGeneMatrix、Tris‑HCl、SDS、KCl、EDTA和Sarkosyl组成，本发明能够实现快速高效提取EBV核酸，将EBV的提取检测限提高到100拷贝数/ml；从复杂样本中亦能快速高效提取到EBV核酸，验证了本提取方法潜在的临床适用性。
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