公开(公告)号：CN104200133A

公开(公告)日：2014-12-10

申请号：CN201410482300.8

申请日：2014-09-19

Applicant: 中南大学

Inventor： 王建新 ,  罗军伟 ,  李敏

IPC: G06F19/18

Abstract: 本发明公开了一种基于读数和距离分布的基因组De novo序列拼接方法，采用De Bruijn图存储读数之间的重叠关系，基于读数分布提出了一种新的打分函数用在contig构建、scaffolding和填充空白区域等步骤。该打分函数充分考虑了测序深度，k-mer频次以及在复杂重复区中insertsize的偏移。本发明简单易用，在不同的模拟和真实测序数据上表现出良好的拼接结果，较其他序列拼接方法具有更高的连续性和完整性。

公开(公告)号：CN104156634A

公开(公告)日：2014-11-19

申请号：CN201410399693.6

申请日：2014-08-14

Applicant: 中南大学

Inventor： 王建新 ,  彭小清 ,  李敏 ,  罗军伟 ,  钟坚成

IPC: G06F19/18

Abstract: 本发明公开了一种基于亚细胞定位特异性的关键蛋白质识别方法，包括以下步骤：步骤1：建立亚细胞定位的蛋白质相互作用子网；步骤2：衡量各个蛋白质亚细胞定位相互作用子网的蛋白质关键性得分的可信度；步骤3：计算所有蛋白质的关键性综合得分：步骤4：输出结果：对细胞内所有蛋白质按关键性综合得分排序并输出排序结果。该基于亚细胞定位特异性的关键蛋白质识别方法在关键蛋白质的识别方面准确性高、敏感度高。