公开(公告)号：CN117292756A

公开(公告)日：2023-12-26

申请号：CN202311136170.8

申请日：2023-09-01

Applicant: 鹏城实验室

Inventor： 陈杰 ,  聂志伟 ,  刘旭东 ,  王振楠 ,  黄显淞 ,  田永鸿

IPC: G16B40/20 ,  G16B20/00 ,  G06F18/211 ,  G06F18/214 ,  G06F18/24 ,  G06F18/27 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/047

Abstract: 本申请实施例提供了病毒性质预测模型训练方法和病毒性质预测方法，通过由病毒蛋白质序列数据集提取的特征训练预测模型得到目标预测模型；在训练模型的过程中，根据第一模型预测结果、回归标签和第一惩罚指数得到回归任务的回归损失函数值，根据第二模型预测结果、分类标签、第二惩罚指数和权重系数得到分类任务的分类损失函数值，根据回归损失函数值和分类损失函数值调整模型参数，通过第一惩罚指数指导对回归任务中的负样本的惩罚程度，通过第二惩罚指数指导对分类任务中的负样本的惩罚程度，通过权重系数调整分类损失函数对于分类任务的正样本的注重程度，从而解决训练数据正负样本不平衡问题。

公开(公告)号：CN117577188A

公开(公告)日：2024-02-20

申请号：CN202311131474.5

申请日：2023-09-01

Applicant: 鹏城实验室

Inventor： 陈杰 ,  聂志伟 ,  刘旭东 ,  王宇 ,  黄显淞 ,  田永鸿

IPC: G16B40/00 ,  G16B20/50 ,  G16B25/10

Abstract: 本申请提出一种高风险变异毒株预测方法、电子设备和存储介质。方法通过从预设的毒株序列数据集中提取第一毒株序列以及由第一毒株序列变异得到的所有第二毒株序列，根据第一毒株序列和所有第二毒株序列确定毒株的突变数量倍率、每个位点的突变频率以及残基分布；根据起始毒株序列、突变数量倍率、突变频率和残基分布生成预测毒株序列；根据多个预设指标对预测毒株序列进行高通量筛选，得到目标毒株序列，最后根据湿实验结果从目标毒株序列中筛选高风险变异株。应用本申请能基于毒株的变异趋势预测生成预测毒株序列，再根据各项预设指标筛选出目标毒株序列，再通过湿实验验证毒株在真实环境中的各项性质，从而准确地预测出高风险变异毒株。