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公开(公告)号：CN119020533B
公开(公告)日：2025-03-18
申请号：CN202411487273.3
申请日：2024-10-24
Applicant: 浙江大学海南研究院 , 阿里巴巴达摩院(杭州)科技有限公司
Abstract: 本发明提供一个与棉花衣分关联的紫色酸性磷酸酶基因及其应用，属于生物技术应用领域，基因GhPAP18在四倍体陆地棉TM‑1中的cDNA序列为：SEQ ID NO.1，所编码氨基酸的序列为：SEQ ID NO.2，基因组DNA序列为：SEQ ID NO.3。GhPAP18基因受邻近SNP位点（D13:50288965）调控，该SNP碱基从胞嘧啶（C）突变为胸腺嘧啶（T），突变后的基因型衣分显著高于突变前。本发明还提供一种鉴定高衣分棉花品种的方法及一种通过基因工程手段培育棉花高衣分新品种的应用。
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公开(公告)号：CN113223612B
公开(公告)日：2024-08-02
申请号：CN202110481497.3
申请日：2021-04-30
Applicant: 阿里巴巴达摩院(杭州)科技有限公司
Abstract: 本发明实施例提供了一种基因组的特征提取方法、疾病预测方法、装置及设备。特征提取方法包括：获取待处理的基因片段，基因片段中包括碱基质量；基于碱基质量，确定与基因片段相对应的置信度；基于基因片段所对应的置信度对基因片段进行特征提取操作，获得基因片段的基因特征。本实施例提供的技术方案，通过获取待处理的基因片段，而后基于基因片段中包括的碱基质量来确定与基因片段相对应的置信度，并基于置信度对基因片段进行特征提取操作，获得基因片段的基因特征，有效地实现了在不增加数据维度的基础上，将碱基质量有效的融入了基因特征中，这样不仅保证了基因特征提取的完整程度，并且还提高了对基因特征进行提取操作的运行效率。
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公开(公告)号：CN119763657A
公开(公告)日：2025-04-04
申请号：CN202411776813.X
申请日：2024-12-04
Applicant: 阿里巴巴达摩院(杭州)科技有限公司
Abstract: 本发明实施例提供一种基因数据处理方法、设备、存储介质和计算机程序产品，该方法包括：根据基因组片段对应的多组学信息训练模型中的第一特征提取网络，此多组学信息对应于细胞群体测序数据。根据功能性元件集合对应的多组学信息，训练模型中的第二特征提取网络，以使模型预测出基因表达信息，此多组学信息对应于单细胞测序数据。上述方案中，模型训练过程中使用到基因组片段以及功能性元件集合中不同功能性元件各自对应的多组学信息，这样可以使预测模型学习到不同种组学信息之间的关系，以使预测模型可以具备良好的特征提取能力，也可以使模型学习到不同功能性元件对基因表达的调控效果，模型也能更加准确地预测出功能性元件对基因表达的影响。
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公开(公告)号：CN119207577A
公开(公告)日：2024-12-27
申请号：CN202411013171.8
申请日：2024-07-23
Applicant: 浙江省疾病预防控制中心(浙江省公共卫生研究院) , 阿里巴巴达摩院(杭州)科技有限公司
Abstract: 本发明实施例提供了一种微生物的溯源方法、多株系变异图谱的构建方法及设备。其中，微生物的溯源方法包括：获取待分析的微生物株系以及所述微生物株系的种属；对所述微生物株系进行变异分析，获得当前株系变异信息；确定位于所述种属下的多个已有微生物株系各自对应的已有株系变异信息；基于所述微生物株系、当前株系变异信息、所述多个已有微生物株系以及所述已有株系变异信息，建立多株系变异图谱，所述多株系变异图谱包括多个节点以及位于两个节点之间的边，所述节点用于标识微生物株系，所述边用于标识同一种属下的两个或者两个以上不同微生物株系之间的变异信息的关联度；基于所述多株系变异图谱，确定所述微生物株系的溯源信息。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN119020533A
公开(公告)日：2024-11-26
申请号：CN202411487273.3
申请日：2024-10-24
Applicant: 浙江大学海南研究院 , 阿里巴巴达摩院(杭州)科技有限公司
Abstract: 本发明提供一个与棉花衣分关联的紫色酸性磷酸酶基因及其应用，属于生物技术应用领域，基因GhPAP18在四倍体陆地棉TM‑1中的cDNA序列为：SEQ ID NO.1，所编码氨基酸的序列为：SEQ ID NO.2，基因组DNA序列为：SEQ ID NO.3。GhPAP18基因受邻近SNP位点（D13:50288965）调控，该SNP碱基从胞嘧啶（C）突变为胸腺嘧啶（T），突变后的基因型衣分显著高于突变前。本发明还提供一种鉴定高衣分棉花品种的方法及一种通过基因工程手段培育棉花高衣分新品种的应用。
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公开(公告)号：CN119763656A
公开(公告)日：2025-04-04
申请号：CN202411775980.2
申请日：2024-12-04
Applicant: 阿里巴巴达摩院(杭州)科技有限公司
Abstract: 本发明实施例提供一种基因数据处理方法、设备、介质和产品，该方法包括：对于需要研究的目标基因，将该目标基因对应的初始多组学信息输入预测模型，以根据预测模型确定出的该目标基因的注意力分值定位该目标基因的增强子。把目标基因对应的初始多组学信息以及将增强子的表观遗传组学信息置零得到的、目标基因对应的第一多组学信息分别输入预测模型，以由模型输出目标基因的第一基因表达量以及第二基因表达量。最终，通过基因表达量的比较即可确定增强子对目标基因的调控方向。上述方法中，借助预测模型得到的相关数据可以实现在不同场景下对基因表达调控进行研究，从而可以提高研究效率，也可以降低研究成本。
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公开(公告)号：CN113517022B
公开(公告)日：2024-06-25
申请号：CN202110648180.4
申请日：2021-06-10
Applicant: 阿里巴巴达摩院(杭州)科技有限公司
IPC: G16B20/20
Abstract: 本发明实施例提供了一种基因检测方法、特征提取方法、装置、设备及系统。基因检测方法包括：获取待处理的基因序列，基因序列中每个位置所对应基因片段的平均数量小于或等于预设阈值；对基因序列进行特征提取操作，获得基因特征；对基因特征进行增强处理，获得与基因特征相对应的增强后特征；基于增强后特征对基因序列进行检测，获得检测结果。本实施例提供的技术方案，通过对基因序列进行特征提取操作，获得基因特征，而后对基因特征进行增强处理，获得增强后特征，之后基于增强后特征对基因序列进行检测，获得检测结果，这样不仅保证了基因检测操作的精确度，并且还有效地降低了数据处理成本和数据处理量。
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公开(公告)号：CN113539357B
公开(公告)日：2024-04-30
申请号：CN202110649698.X
申请日：2021-06-10
Applicant: 阿里巴巴达摩院(杭州)科技有限公司
IPC: G16B20/30 , G16B40/00 , G06N3/08 , G06N3/0464
Abstract: 本发明实施例提供了一种基因检测方法、模型训练方法、装置、设备及系统。基因检测方法包括：获取待处理基因数据，待处理基因数据中每个位置所对应基因片段的平均数量小于或等于预设阈值；将待处理基因数据输入至特征生成网络层进行特征提取操作，获得与待处理基因数据相对应的基因特征和与基因特征相对应的增强后特征；将待处理基因数据和增强后特征输入至基因识别网络层进行基因检测操作，获得检测结果。本实施例提供的技术方案，实现了通过低深度的基因数据进行特征提取操作，获得基因特征和与基因特征相对应的增强后特征，并基于增强后特征进行检测操作，这样不仅保证了基因检测结果的精确度，并且还降低了数据处理成本和数据处理量。
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公开(公告)号：CN114912040A
公开(公告)日：2022-08-16
申请号：CN202210411433.0
申请日：2022-04-19
Applicant: 中国农业科学院作物科学研究所 , 阿里巴巴达摩院(杭州)科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种育种处理方法、装置及计算机可读存储介质。其中，该方法包括：获取待选种子；获取待选种子的基因数据；获取待选种子的育种环境数据；基于基因数据和育种环境数据，采用深度学习模型，预测待选种子的表型数据。本发明解决了由于数据处理效率低造成的育种进度缓慢的技术问题。
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