公开(公告)号：CN113724785B

公开(公告)日：2022-02-08

申请号：CN202111280404.7

申请日：2021-11-01

Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司

Inventor： 周杨 ,  孙怀博 ,  郝沛 ,  杜波

IPC: G16B20/50 ,  G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明公开了一种基于二代测序的肿瘤分型装置、方法、存储介质及设备，属于生物检测技术领域。包括获取基因测序数据；对测序数据进行预处理；根据测序深度，计算每个变异在不同样本中的等位基因频率；根据每个变异在不同样本中的等位基因频率，计算每个变异在混合样本中的等位基因频率；根据变异种类及其在单个样本中的等位基因频率，计算单个样本的信息熵；基于变异种类及其在混合样本中的等位基因频率，计算混合样本的信息熵；基于同一患者单个样本和混合样本的信息熵计算熵差；根据混合样本信息熵差计算患者的特征值，并根据特征值阈值进行肿瘤分型。所述装置、存储介质和设备，基于所述方法实现。本发明能够对肿瘤进行准确分型，具有较强的临床适用性。

公开(公告)号：CN113724785A

公开(公告)日：2021-11-30

申请号：CN202111280404.7

申请日：2021-11-01

Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司

Inventor： 周杨 ,  孙怀博 ,  郝沛 ,  杜波

IPC: G16B20/50 ,  G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明公开了一种基于二代测序的肿瘤分型装置、方法、存储介质及设备，属于生物检测技术领域。包括获取基因测序数据；对测序数据进行预处理；根据测序深度，计算每个变异在不同样本中的等位基因频率；根据每个变异在不同样本中的等位基因频率，计算每个变异在混合样本中的等位基因频率；根据变异种类及其在单个样本中的等位基因频率，计算单个样本的信息熵；基于变异种类及其在混合样本中的等位基因频率，计算混合样本的信息熵；基于同一患者单个样本和混合样本的信息熵计算熵差；根据混合样本信息熵差计算患者的特征值，并根据特征值阈值进行肿瘤分型。所述装置、存储介质和设备，基于所述方法实现。本发明能够对肿瘤进行准确分型，具有较强的临床适用性。