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公开(公告)号:CN105461789B
公开(公告)日:2019-05-07
申请号:CN201510950636.7
申请日:2015-12-19
Applicant: 福建农林大学
IPC: C07K14/415 , C07K16/16 , C07K16/06
Abstract: 本发明提供一种二穗短柄草功能着丝粒组蛋白CENH3及应用。首先利用生物信息学序列比对的方法预测得到二穗短柄草CENH3蛋白基因的核苷酸序列,根据该序列编码的氨基酸序列N端的一段特异序列合成一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体。该CENH3抗体可用于免疫染色实验,进行着丝粒的物理定位,亦可用于染色质免疫沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)实验,获得二穗短柄草功能着丝粒功能DNA序列,开展着丝粒基因组遗传图谱与物理图谱的定位,为着丝粒形成与功能行使机制的研究及其人工染色体的构建提供重要的工具和信息。
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公开(公告)号:CN105399805B
公开(公告)日:2019-04-02
申请号:CN201510950638.6
申请日:2015-12-19
Applicant: 福建农林大学
IPC: C07K14/415 , C07K16/16 , C07K16/06
Abstract: 本发明提供了木瓜功能着丝粒抗原多肽及其应用,木瓜功能着丝粒组蛋白CENH3,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,根据该序列编码的氨基酸序列的N端的一段特异序列合成了一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体,进行了该抗体的免疫荧光实验。本发明的木瓜CENH3蛋白的抗体可用于木瓜功能着丝粒位置的细胞学定位,也能应用在与木瓜的染色质免疫沉淀技术相结合的测序(ChIP‑seq)上面,能够确定木瓜染色体上功能着丝粒的位置和大小以及序列信息,使得其物理图谱信息更加全面,并且能在木瓜基因组的组装方面提供着丝粒方面的信息。
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公开(公告)号:CN104818331A
公开(公告)日:2015-08-05
申请号:CN201510225766.4
申请日:2015-05-06
Applicant: 福建农林大学
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/158
Abstract: 本发明提供了雷蒙德氏棉功能着丝粒序列及其相应的分子标记。我们利用染色质免疫共沉淀与高通量测序技术相结合(ChIP-Seq)的方法得到了雷蒙德氏棉功能着丝粒区域的四条DNA序列。根据该序列分别设计引物,用于雷蒙德氏棉有丝分裂中期荧光原位杂交(FISH)。结果显示,这四条序列均在全部染色体的着丝粒区域产生集中且清晰明亮的信号。本发明的着丝粒序列可直接用于功能着丝粒的定位及相关序列的鉴定;所开发的标记可用于棉花遗传图谱着丝粒位置的遗传定位,为功能基因定位及连锁关系提供更加准确的信息,也能为雷蒙德氏棉全基因组测序的序列拼接提供借鉴和帮助,使得其物理图谱信息更加全面。
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公开(公告)号:CN104818331B
公开(公告)日:2017-09-22
申请号:CN201510225766.4
申请日:2015-05-06
Applicant: 福建农林大学
Abstract: 本发明提供了雷蒙德氏棉功能着丝粒序列及其相应的分子标记。我们利用染色质免疫共沉淀与高通量测序技术相结合(ChIP‑Seq)的方法得到了雷蒙德氏棉功能着丝粒区域的四条DNA序列。根据该序列分别设计引物,用于雷蒙德氏棉有丝分裂中期荧光原位杂交(FISH)。结果显示,这四条序列均在全部染色体的着丝粒区域产生集中且清晰明亮的信号。本发明的着丝粒序列可直接用于功能着丝粒的定位及相关序列的鉴定;所开发的标记可用于棉花遗传图谱着丝粒位置的遗传定位,为功能基因定位及连锁关系提供更加准确的信息,也能为雷蒙德氏棉全基因组测序的序列拼接提供借鉴和帮助,使得其物理图谱信息更加全面。
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公开(公告)号:CN105418740B
公开(公告)日:2019-03-12
申请号:CN201510950637.1
申请日:2015-12-19
Applicant: 福建农林大学
IPC: C07K14/415 , C07K16/16 , C07K16/06
Abstract: 本发明提供了菠萝功能着丝粒抗原多肽及其应用,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,根据该氨基酸序列的N端的一段特异序列合成一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体,进行该抗体的免疫荧光实验,本发明的菠萝CENH3蛋白的抗体可用于菠萝功能着丝粒位置的细胞学定位,也能应用在与菠萝的染色质免疫沉淀技术相结合的测序(ChIP‑seq)上面,确定菠萝染色体上功能着丝粒的位置和大小以及序列信息,开展着丝粒基因组遗传图谱与物理图谱的定位,为着丝粒形成与功能行使机制的研究及其人工染色体的构建提供重要的工具和信息。
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公开(公告)号:CN105461789A
公开(公告)日:2016-04-06
申请号:CN201510950636.7
申请日:2015-12-19
Applicant: 福建农林大学
IPC: C07K14/415 , C07K16/16 , C07K16/06
CPC classification number: C07K14/415 , C07K16/06 , C07K16/16
Abstract: 本发明提供一种二穗短柄草功能着丝粒组蛋白CENH3及应用。首先利用生物信息学序列比对的方法预测得到二穗短柄草CENH3蛋白基因的核苷酸序列,根据该序列编码的氨基酸序列N端的一段特异序列合成一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体。该CENH3抗体可用于免疫染色实验,进行着丝粒的物理定位,亦可用于染色质免疫沉淀(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)实验,获得二穗短柄草功能着丝粒功能DNA序列,开展着丝粒基因组遗传图谱与物理图谱的定位,为着丝粒形成与功能行使机制的研究及其人工染色体的构建提供重要的工具和信息。
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公开(公告)号:CN105418740A
公开(公告)日:2016-03-23
申请号:CN201510950637.1
申请日:2015-12-19
Applicant: 福建农林大学
IPC: C07K14/415 , C07K16/16 , C07K16/06
CPC classification number: C07K14/415 , C07K16/06 , C07K16/16
Abstract: 本发明提供了菠萝功能着丝粒抗原多肽及其应用,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,根据该氨基酸序列的N端的一段特异序列合成一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体,进行该抗体的免疫荧光实验,本发明的菠萝CENH3蛋白的抗体可用于菠萝功能着丝粒位置的细胞学定位,也能应用在与菠萝的染色质免疫沉淀技术相结合的测序(ChIP-seq)上面,确定菠萝染色体上功能着丝粒的位置和大小以及序列信息,开展着丝粒基因组遗传图谱与物理图谱的定位,为着丝粒形成与功能行使机制的研究及其人工染色体的构建提供重要的工具和信息。
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公开(公告)号:CN105399805A
公开(公告)日:2016-03-16
申请号:CN201510950638.6
申请日:2015-12-19
Applicant: 福建农林大学
IPC: C07K14/415 , C07K16/16 , C07K16/06
CPC classification number: C07K14/415 , C07K16/06 , C07K16/16
Abstract: 本发明提供了木瓜功能着丝粒抗原多肽及其应用,木瓜功能着丝粒组蛋白CENH3,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,根据该序列编码的氨基酸序列的N端的一段特异序列合成了一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体,进行了该抗体的免疫荧光实验。本发明的木瓜CENH3蛋白的抗体可用于木瓜功能着丝粒位置的细胞学定位,也能应用在与木瓜的染色质免疫沉淀技术相结合的测序(ChIP-seq)上面,能够确定木瓜染色体上功能着丝粒的位置和大小以及序列信息,使得其物理图谱信息更加全面,并且能在木瓜基因组的组装方面提供着丝粒方面的信息。
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