公开(公告)号：CN113160887B

公开(公告)日：2022-06-14

申请号：CN202110443345.4

申请日：2021-04-23

Applicant: 哈尔滨工业大学

Inventor： 蒋庆华 ,  许召春 ,  王平平 ,  周文洋

IPC: G16B20/50 ,  G16B50/00 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6886 ,  G16B5/00 ,  G16B30/10 ,  G16B30/20

Abstract: 本发明公开了一种融合了单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法，包括：基于全外显子测序数据及转录组测序数据通过软件进行质控、比对等步骤获取新生突变肽库；使用HLA分型预测软件预测HLA‑I类分型；结合单细胞TCR测序及单细胞转录组测序，通过细胞类型注释、克隆频率分析寻找癌症特异性的CD8+T细胞受体；同时，基于集成深度学习通过peptide‑TCR相互作用预测模型鉴定短肽免疫原性，提出融合单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法，解决了传统肿瘤抗原筛选方法新生抗原错选漏选率高、免疫原性不足等问题。

公开(公告)号：CN113160887A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110443345.4

申请日：2021-04-23

Applicant: 哈尔滨工业大学

Inventor： 蒋庆华 ,  许召春 ,  王平平 ,  周文洋

IPC: G16B20/50 ,  G16B50/00 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6886 ,  G16B5/00 ,  G16B30/10 ,  G16B30/20

Abstract: 本发明公开了一种融合了单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法，包括：基于全外显子测序数据及转录组测序数据通过软件进行质控、比对等步骤获取新生突变肽库；使用HLA分型预测软件预测HLA‑I类分型；结合单细胞TCR测序及单细胞转录组测序，通过细胞类型注释、克隆频率分析寻找癌症特异性的CD8+T细胞受体；同时，基于集成深度学习通过peptide‑TCR相互作用预测模型鉴定短肽免疫原性，提出融合单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法，解决了传统肿瘤抗原筛选方法新生抗原错选漏选率高、免疫原性不足等问题。