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公开(公告)号:CN115171793A
公开(公告)日:2022-10-11
申请号:CN202210883046.7
申请日:2022-07-26
Applicant: 厦门大学
Abstract: 本发明公开了一种TCR序列编码可视化方法,包括以下步骤:S1、获取TCR测序数据并进行预处理;S2、基于预处理后的TCR测序数据,生成训练数据;S3、搭建深度学习模型,使用训练数据对深度学习模型进行训练;S4、设置深度学习模型的输出层,将TCR编码为数据点并进行可视化;该TCR序列编码可视化方法保留不同TCR分子的相似性,将TCR序列编码到高维欧式空间中,使相似的TCR在嵌入空间中排列更加紧密,并将其映射到低维空间进行可视化,可为潜在特异性TCR的鉴别提供新的途径。