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公开(公告)号:CN111518916B
公开(公告)日:2022-07-15
申请号:CN202010157940.7
申请日:2020-03-09
Applicant: 南京农业大学 , 南京农业大学淮安研究院
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了猪13号染色体与二花脸猪产活仔数显著相关的SNP标记及其检测方法与应用。所述SNP标记位于猪13号染色体上的钙同线蛋白2(CLSTN2)基因的核苷酸序列上,所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪13号染色体上chr13_81429549核苷酸位点,且存在T/C多态性,所述SNP标记与二花脸猪与经产胎次的产活仔数(P=0.0479)显著相关,与全部胎次的产活仔数极显著相关(P=0.0383)。一种用于检测本发明所述的SNP标记的引物对,上游引物为:SEQ ID NO:2,下游引物为:SEQ ID NO:3。本发明提供的SNP标记与二花脸母猪的产活仔数相关。
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公开(公告)号:CN111454940B
公开(公告)日:2022-05-20
申请号:CN202010281947.X
申请日:2020-04-11
Applicant: 南京农业大学 , 南京农业大学淮安研究院
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6806 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种用于高通量SNP分型的猪毛囊DNA高效提取的方法,此方法基于传统酚‑氯仿法改进形成的新的酚‑氯仿法从猪毛囊中高效提取完整基因组DNA,且获得的DNA纯度和浓度较好,可以用于高通量SNP分型技术。该方法内容为采集猪的毛囊组织,加组织抽提液和蛋白酶K对其进行消化,用Tris饱和酚、饱和酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)、氯仿进行DNA的抽提,使用冰乙醇进行DNA沉淀,用70%的乙醇进行洗涤,晾干后得到DNA样品。利用该方法提取的基因组DNA的纯度好,完整性好,完全满足高通量SNP分型对DNA的质量及总量的要求,且经济性好,具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN111455071A
公开(公告)日:2020-07-28
申请号:CN202010438476.9
申请日:2020-05-22
Applicant: 南京农业大学 , 南京农业大学淮安研究院
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了猪8号染色体上与二花脸猪全部胎次总产仔数相关的SNP标记的检测方法与应用。所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪8号染色体上rs342939847核苷酸位点,且存在A/C多态性,所述SNP标记与二花脸猪全部胎次的总产仔数显著相关(P=0.0418)。一种用于检测本发明所述的SNP标记的引物对,上游引物为:SEQ ID NO:2,下游引物为:SEQ ID NO:3。本发明提供的SNP标记与二花脸母猪的总产仔数相关,因此,可以通过鉴定该SNP标记来筛选高产的二花脸母猪品系,所得的二花脸母猪高产品系具有重要的经济效益与社会价值。
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公开(公告)号:CN111454940A
公开(公告)日:2020-07-28
申请号:CN202010281947.X
申请日:2020-04-11
Applicant: 南京农业大学 , 南京农业大学淮安研究院
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6806 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种用于高通量SNP分型的猪毛囊DNA高效提取的方法,此方法基于传统酚-氯仿法改进形成的新的酚-氯仿法从猪毛囊中高效提取完整基因组DNA,且获得的DNA纯度和浓度较好,可以用于高通量SNP分型技术。该方法内容为采集猪的毛囊组织,加组织抽提液和蛋白酶K对其进行消化,用Tris饱和酚、饱和酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)、氯仿进行DNA的抽提,使用冰乙醇进行DNA沉淀,用70%的乙醇进行洗涤,晾干后得到DNA样品。利用该方法提取的基因组DNA的纯度好,完整性好,完全满足高通量SNP分型对DNA的质量及总量的要求,且经济性好,具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN111518916A
公开(公告)日:2020-08-11
申请号:CN202010157940.7
申请日:2020-03-09
Applicant: 南京农业大学 , 南京农业大学淮安研究院
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了猪13号染色体与二花脸猪产活仔数显著相关的SNP标记及其检测方法与应用。所述SNP标记位于猪13号染色体上的钙同线蛋白2(CLSTN2)基因的核苷酸序列上,所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪13号染色体上chr13_81429549核苷酸位点,且存在T/C多态性,所述SNP标记与二花脸猪与经产胎次的产活仔数(P=0.0479)显著相关,与全部胎次的产活仔数极显著相关(P=0.0383)。一种用于检测本发明所述的SNP标记的引物对,上游引物为:SEQ ID NO:2,下游引物为:SEQ ID NO:3。本发明提供的SNP标记与二花脸母猪的产活仔数相关。
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公开(公告)号:CN111455071B
公开(公告)日:2022-07-15
申请号:CN202010438476.9
申请日:2020-05-22
Applicant: 南京农业大学 , 南京农业大学淮安研究院
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了猪8号染色体上与二花脸猪全部胎次总产仔数相关的SNP标记的检测方法与应用。所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪8号染色体上rs342939847核苷酸位点,且存在A/C多态性,所述SNP标记与二花脸猪全部胎次的总产仔数显著相关(P=0.0418)。一种用于检测本发明所述的SNP标记的引物对,上游引物为:SEQ ID NO:2,下游引物为:SEQ ID NO:3。本发明提供的SNP标记与二花脸母猪的总产仔数相关,因此,可以通过鉴定该SNP标记来筛选高产的二花脸母猪品系,所得的二花脸母猪高产品系具有重要的经济效益与社会价值。
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公开(公告)号:CN112501311B
公开(公告)日:2022-04-01
申请号:CN202011509529.8
申请日:2020-12-18
Applicant: 南京农业大学 , 淮安沐林新农村发展研究有限公司
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与猪乳头数性状相关的SNP标记引物对及其应用。所述SNP标记位于猪1号染色体上的SAMD4A基因的核苷酸序列上,所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs80844123核苷酸位点的分子标记,且具有A/G多态性,所述SNP标记与苏淮猪乳头数极显著相关(P
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公开(公告)号:CN113817841B
公开(公告)日:2023-10-10
申请号:CN202111129329.4
申请日:2021-09-26
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与猪乳头数性状相关的SNP标记引物对及其应用。所述SNP标记位于猪12号染色体上的rs334727649核苷酸位点上,所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪12号染色体rs334727649核苷酸位点的分子标记,且具有T/C多态性,所述SNP标记与苏淮猪乳头数极显著相关(P
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公开(公告)号:CN113817841A
公开(公告)日:2021-12-21
申请号:CN202111129329.4
申请日:2021-09-26
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与猪乳头数性状相关的SNP标记引物对及其应用。所述SNP标记位于猪12号染色体上的rs334727649核苷酸位点上,所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪12号染色体rs334727649核苷酸位点的分子标记,且具有T/C多态性,所述SNP标记与苏淮猪乳头数极显著相关(P
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