公开(公告)号：CN103116712A

公开(公告)日：2013-05-22

申请号：CN201310044321.7

申请日：2013-02-04

Applicant: 南京信息工程大学

Inventor： 刘文杰 ,  王芳 ,  郑玉 ,  季赛

IPC: G06F19/16

Abstract: 本发明提出了基于可变角距离QEA算法的蛋白质HP模型求解方法，所述方法通过将基于可变角距离的量子进化算法运用到蛋白质二级结构预测中，在量子进化算法框架基础上，引入可变角距离进化策略；在HP构型表示上采用灵活高效的方向解形式；为了增加方向解的多样性引入一种方向牵引机制，从而使得本发明能够高效率地找到蛋白质最低能量构型；所述方法采用方向解替代以往的坐标解，有利于无效闭环HP构型检测和修复，从而提高方法执行速度。本发明方法使用了方向解形式、回退法、方向牵引策略、可变角距离等技术或策略，使得本发明效率上更优于其他方法。

公开(公告)号：CN103116712B

公开(公告)日：2016-02-03

申请号：CN201310044321.7

申请日：2013-02-04

Applicant: 南京信息工程大学

Inventor： 刘文杰 ,  王芳 ,  郑玉 ,  季赛

IPC: G06F19/16

Abstract: 本发明提出了基于可变角距离QEA算法的蛋白质HP模型求解方法，所述方法通过将基于可变角距离的量子进化算法运用到蛋白质二级结构预测中，在量子进化算法框架基础上，引入可变角距离进化策略；在HP构型表示上采用灵活高效的方向解形式；为了增加方向解的多样性引入一种方向牵引机制，从而使得本发明能够高效率地找到蛋白质最低能量构型；所述方法采用方向解替代以往的坐标解，有利于无效闭环HP构型检测和修复，从而提高方法执行速度。本发明方法使用了方向解形式、回退法、方向牵引策略、可变角距离等技术或策略，使得本发明效率上更优于其他方法。