公开(公告)号：CN115976222A

公开(公告)日：2023-04-18

申请号：CN202210805622.6

申请日：2022-07-08

Applicant: 北部湾大学

Inventor： 杨家林 ,  王鹏良 ,  杨果豪 ,  朱鹏 ,  许尤厚 ,  黄碧玲 ,  覃雯霞

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及一种施氏獭蛤SSR引物组及其应用，本发明以施氏獭蛤为材料，利用PacBio测序平台完成施氏獭蛤的全长转录组测序，并利用MISA搜索SSR位点，得到438个SSR位点，根据SSR位点设计出11对施氏獭蛤的SSR分子标记引物，通过验证，该引物的等位基因数目和多态信息指数远高于现有技术开发的施氏獭蛤SSR引物，具有多态性好，特异性高，有效区分参试样本，甚至在亲缘关系较近的几个本地品种中都能对施氏獭蛤进行有效区分的特点，同时，本申请利用该引物组进行聚类分析、绘制DNA指纹图谱都能取得良好的效果，能为今后施氏獭蛤开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的基因位点和鉴定引物。

公开(公告)号：CN115976222B

公开(公告)日：2024-07-16

申请号：CN202210805622.6

申请日：2022-07-08

Applicant: 北部湾大学

Inventor： 杨家林 ,  王鹏良 ,  杨果豪 ,  朱鹏 ,  许尤厚 ,  黄碧玲 ,  覃雯霞

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及一种施氏獭蛤SSR引物组及其应用，本发明以施氏獭蛤为材料，利用PacBio测序平台完成施氏獭蛤的全长转录组测序，并利用MISA搜索SSR位点，得到438个SSR位点，根据SSR位点设计出11对施氏獭蛤的SSR分子标记引物，通过验证，该引物的等位基因数目和多态信息指数远高于现有技术开发的施氏獭蛤SSR引物，具有多态性好，特异性高，有效区分参试样本，甚至在亲缘关系较近的几个本地品种中都能对施氏獭蛤进行有效区分的特点，同时，本申请利用该引物组进行聚类分析、绘制DNA指纹图谱都能取得良好的效果，能为今后施氏獭蛤开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的基因位点和鉴定引物。