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公开(公告)号：CN117106857B
公开(公告)日：2024-02-09
申请号：CN202311376969.4
申请日：2023-10-24
Applicant: 北京大学
IPC: C12Q1/6804 , G16B30/00 , G16B5/00 , G16B50/10 , G16H50/20
Abstract: 本发明提供了一种血浆游离染色质的检测方法、试剂盒及其应用，涉及生物技术领域。该试剂盒包括载体和转座体，载体带有能特异性结合游离组蛋白的表位的抗体或其抗原结合片段；载体为抗体‑磁珠复合体或抗原结合片段‑磁珠复合体。该方法包括整合分析公共数据获得的组织细胞特异性染色质状态特征集合、利用组织特异性染色质状态集合判定血浆游离染色质组织细胞起源的方法、综合血浆游离染色质组织特异性信号判断个体健康状况的无偏诊断方法和利用血浆游离染色质状态定义游离染色质基因调控的方法。本发明提供的试剂盒和方法成本低、捕获效率高，程序算法高效成熟，适用于无偏的无创诊断及疾病分型、追踪等临床应用场景。
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公开(公告)号：CN108285494B
公开(公告)日：2021-09-07
申请号：CN201810142875.3
申请日：2018-02-11
Applicant: 北京大学
IPC: C07K19/00 , C12N9/12 , C12Q1/6804 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及一种融合蛋白、试剂盒以及CHIP‑seq检测方法，其中，所述融合蛋白包括Tn5转座酶和Fc结合蛋白，所述试剂盒包括前述融合蛋白以及其他辅助检测试剂，所述方法使用前述融合蛋白或试剂盒进行CHIP‑seq检测方法。本发明所述融合蛋白、试剂盒和方法在CHIP‑seq检测过程中能够提高建库效率，降低文库背景，从而提高CHIP‑seq检测方法的准确性并简化CHIP‑seq的实验流程。
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公开(公告)号：CN108315387B
公开(公告)日：2021-02-02
申请号：CN201810121175.6
申请日：2018-02-07
Applicant: 北京大学
IPC: C12Q1/6804
Abstract: 本发明涉及一种微量细胞ChIP法。所述方法包括：1).将待检测细胞样品分为n组，n为非0自然数；2).将第n组样品交联固定；3).使用细胞膜打孔剂处理所述第n组样品；4).使用Tn5转座酶酶切打断第n组样品的染色质片段，并将barcode序列和引物序列连接在产物片段DNA的两端；当n≥2时，步骤4)中每组所用的barcode序列和/或引物序列不同；5).当n≥2时，将各组样品合并；6).富集与靶蛋白结合的DNA片段，并用以所述引物作为index建库，测序分析。该方法测序时建库效率高，且能实现对极微量细胞的转录因子位点捕捉，并保证较好效率，稳定性和精确度都较好。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108285494A
公开(公告)日：2018-07-17
申请号：CN201810142875.3
申请日：2018-02-11
Applicant: 北京大学
IPC: C07K19/00 , C12N9/12 , C12Q1/6804 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及一种融合蛋白、试剂盒以及CHIP-seq检测方法，其中，所述融合蛋白包括Tn5转座酶和Fc结合蛋白，所述试剂盒包括前述融合蛋白以及其他辅助检测试剂，所述方法使用前述融合蛋白或试剂盒进行CHIP-seq检测方法。本发明所述融合蛋白、试剂盒和方法在CHIP-seq检测过程中能够提高建库效率，降低文库背景，从而提高CHIP-seq检测方法的准确性并简化CHIP-seq的实验流程。
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公开(公告)号：CN110372799A
公开(公告)日：2019-10-25
申请号：CN201910709933.0
申请日：2019-08-01
Applicant: 北京大学
IPC: C07K19/00 , C12N9/12 , C40B50/06 , C12Q1/6806 , C12N15/10
Abstract: 本发明涉及一种用于单细胞ChIP-seq文库制备的融合蛋白及其应用，其中，所述融合蛋白包括Tn5转座酶和Fc结合蛋白，所述试剂盒包括前述融合蛋白以及其他辅助检测试剂，所述方法使用前述融合蛋白或试剂盒进行ChIP-seq检测方法。本发明所述融合蛋白、试剂盒和方法在ChIP-seq检测过程中能够提高建库效率，降低文库背景，从而提高ChIP-seq检测方法的准确性并简化ChIP-seq的实验流程。
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公开(公告)号：CN110372799B
公开(公告)日：2020-06-09
申请号：CN201910709933.0
申请日：2019-08-01
Applicant: 北京大学
IPC: C07K19/00 , C12N9/12 , C40B50/06 , C12Q1/6806 , C12N15/10
Abstract: 本发明涉及一种用于单细胞ChIP‑seq文库制备的融合蛋白及其应用，其中，所述融合蛋白包括Tn5转座酶和Fc结合蛋白，所述试剂盒包括前述融合蛋白以及其他辅助检测试剂，所述方法使用前述融合蛋白或试剂盒进行ChIP‑seq检测方法。本发明所述融合蛋白、试剂盒和方法在ChIP‑seq检测过程中能够提高建库效率，降低文库背景，从而提高ChIP‑seq检测方法的准确性并简化ChIP‑seq的实验流程。
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公开(公告)号：CN117106857A
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202311376969.4
申请日：2023-10-24
Applicant: 北京大学
IPC: C12Q1/6804 , G16B30/00 , G16B5/00 , G16B50/10 , G16H50/20
Abstract: 本发明提供了一种血浆游离染色质的检测方法、试剂盒及其应用，涉及生物技术领域。该试剂盒包括载体和转座体，载体带有能特异性结合游离组蛋白的表位的抗体或其抗原结合片段；载体为抗体‑磁珠复合体或抗原结合片段‑磁珠复合体。该方法包括整合分析公共数据获得的组织细胞特异性染色质状态特征集合、利用组织特异性染色质状态集合判定血浆游离染色质组织细胞起源的方法、综合血浆游离染色质组织特异性信号判断个体健康状况的无偏诊断方法和利用血浆游离染色质状态定义游离染色质基因调控的方法。本发明提供的试剂盒和方法成本低、捕获效率高，程序算法高效成熟，适用于无偏的无创诊断及疾病分型、追踪等临床应用场景。
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公开(公告)号：CN108315387A
公开(公告)日：2018-07-24
申请号：CN201810121175.6
申请日：2018-02-07
Applicant: 北京大学
IPC: C12Q1/6804
Abstract: 本发明涉及一种微量细胞ChIP法。所述方法包括：1).将待检测细胞样品分为n组，n为非0自然数；2).将第n组样品交联固定；3).使用细胞膜打孔剂处理所述第n组样品；4).使用Tn5转座酶酶切打断第n组样品的染色质片段，并将barcode序列和引物序列连接在产物片段DNA的两端；当n≥2时，步骤4)中每组所用的barcode序列和/或引物序列不同；5).当n≥2时，将各组样品合并；6).富集与靶蛋白结合的DNA片段，并用以所述引物作为index建库，测序分析。该方法测序时建库效率高，且能实现对极微量细胞的转录因子位点捕捉，并保证较好效率，稳定性和精确度都较好。
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