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发明公开
一种预测siRNA沉默效率的方法无效

公开(公告)号：CN111986730A

公开(公告)日：2020-11-24

申请号：CN202010729971.5

申请日：2020-07-27

Applicant: 中国科学院计算技术研究所苏州智能计算产业技术研究院

Inventor： 徐迪 , 张佩珩

IPC: G16B20/30 , G16B40/00 , G06N3/04

Abstract: 本发明揭示了一种预测siRNA沉默效率的方法，其特征在于：在输入层设置特征提取模块对数据集进行特征提取和处理，使用多模motif输入结合词向量预训练模型获得序列词向量、循环神经网络提取序列的潜在特征并引入注意力模型，利用逻辑回归模块计算得到siRNA沉默效率的预测结果。应用本发明预测siRNA沉默效率的技术解决方案，通过训练得到神经网络模型能提高对输入序列进行预测的效率，为实验人员提供效率上的参考，减少试验次数，降低时间与金钱成本；有利于实现沉默效率预测的量化，并提升预测准确度，模型预测效果在Husken数据集上PCC值达到0.716。

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