应用转录组学筛选全氟辛烷磺酸毒性枢纽基因和关键信号通路的方法

    公开(公告)号:CN113053453A

    公开(公告)日:2021-06-29

    申请号:CN202110274920.2

    申请日:2021-03-15

    Inventor: 翁瑞 王天润 邱静

    Abstract: 本发明公开了应用转录组学筛选PFOS毒性枢纽基因和关键信号通路的方法。本发明所提供的方法首先设定实验动物的空白对照组和PFOS暴露组并进行处理获得生物样本,提取所得生物样本的RNA,通过高通量测序仪获得生物样本的转录组学数据,将获得的测序数据进行生物信息学分析,包括差异基因GO富集分析、KEGG通路富集分析、蛋白互作网络分析和GSEA分析,最终筛选得到PFOS的毒性枢纽基因和关键信号通路结果。应用本发明所提供的方法,可为鉴定PFOS对动物或人类造成的严重影响和/或PFOS对动物或人类的毒性机制以及开发针对PFOS毒性的相关药物提供帮助。

    一种基于非靶向代谢组学预测全氟辛烷磺酸(PFOS)暴露毒性机制的方法及其诱发疾病

    公开(公告)号:CN115290809A

    公开(公告)日:2022-11-04

    申请号:CN202210789046.0

    申请日:2022-07-06

    Inventor: 翁瑞 邱静 王天润

    Abstract: 本发明公开了一种基于非靶向代谢组学预测全氟辛烷磺酸(PFOS)暴露毒性机制的方法及其诱发疾病。本发明通过对血清的代谢组学指纹图谱进行分析,建立PCA和OPLS‑DA模型,并对模型的可靠性进行验证;在模型可靠的基础上,筛选PFOS暴露组相对于对照组的差异代谢物并进行富集分析预测PFOS暴露的毒性机制及可能诱发的疾病,并对诱发疾病的疾病进发病风险进行评估。本发明将非靶向代谢组学技术用于PFOS暴露毒性机制和诱发疾病的预测,能够及早发现PFOS暴露的毒性机制和可能诱发的疾病,为PFOS暴露所致疾病筛查提供技术支撑,并为PFOS暴露所致疾病的预防性治疗提供参考依据。

    一种基于脂质组学技术获得的判断PFOS暴露的标志物及其应用

    公开(公告)号:CN114544981A

    公开(公告)日:2022-05-27

    申请号:CN202210162011.4

    申请日:2022-02-22

    Inventor: 翁瑞 邱静 王天润

    Abstract: 本发明公开了一种基于脂质组学技术获得判断PFOS暴露的标志物方法。本发明基于UPLC‑HRMS脂质组学技术分析PFOS暴露与正常对照条件下实验动物的血清的脂质组学的指纹图谱获得了26个差异脂质化合物可作为判断生物体是否存在PFOS暴露的情况生物标志物。所述26个脂质化合物包括11个LPC类、3个LPE类、2个NAE类、9个PC类和1个PE类脂质化合物。通过检测血清中该26个差异脂质化合物可以在不利用PFOS标准品的情况下,利用脂质组学技术是判断生物体是否存在PFOS暴露的情况,可以方便快捷的对PFOS暴露进行判断,防止由于使用PFOS标准品而对环境产生进一步的危害。

    应用转录组学筛选全氟辛烷磺酸毒性枢纽基因和关键信号通路的方法

    公开(公告)号:CN113053453B

    公开(公告)日:2022-01-04

    申请号:CN202110274920.2

    申请日:2021-03-15

    Inventor: 翁瑞 王天润 邱静

    Abstract: 本发明公开了应用转录组学筛选PFOS毒性枢纽基因和关键信号通路的方法。本发明所提供的方法首先设定实验动物的空白对照组和PFOS暴露组并进行处理获得生物样本,提取所得生物样本的RNA,通过高通量测序仪获得生物样本的转录组学数据,将获得的测序数据进行生物信息学分析,包括差异基因GO富集分析、KEGG通路富集分析、蛋白互作网络分析和GSEA分析,最终筛选得到PFOS的毒性枢纽基因和关键信号通路结果。应用本发明所提供的方法,可为鉴定PFOS对动物或人类造成的严重影响和/或PFOS对动物或人类的毒性机制以及开发针对PFOS毒性的相关药物提供帮助。

Patent Agency Ranking